24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 5356  |  回复: 11

qingxueer

金虫 (初入文坛)

[求助] PYMOL与VMD作图的区别 已有2人参与

请哪位同学告诉我一下PYMOL与 VMD蛋白的三维图有什么区别吗?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

caixin5120

木虫 (正式写手)


【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zh1987hs: 金币+3, 菜兄说的在理~ 2012-06-28 09:23:39
VMD除了pymol能实现的作图功能外还可以观看和计算动力学得到的结果。
pymol当然也有其优势,简单易学。其插件可以进分子对接,电荷,电子云分布等计算。

各有其优点,但总体上说,VMD更强悍。
4楼2012-06-28 09:08:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

see_uok

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

个人感觉pymol图形显示能力更好很多文章都用它来做图,VMD的Movie功能更强大
7楼2012-09-11 09:39:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

wohaihao

荣誉版主 (著名写手)

保密局的……

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
一直都在用pymol感觉还不错,没用过vmd
从小到大就没清闲过,要不就是穷,穷的活着没意思,要不就是累,累得活着没意思,现在是又穷又累了
2楼2012-06-28 00:07:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-06-28 09:08:27
这些都是可以实现三维图形显示的软件,好看与否与你的设置有关,从原理上来说,都可以画出蛋白的三维结构,蛋白与小分子的结合构象等等,这些都是共同的~
3楼2012-06-28 08:06:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qingxueer

金虫 (初入文坛)

哦  谢谢大家啊
5楼2012-06-28 21:07:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

autodockytu

捐助贵宾 (小有名气)


初学者用pymol,用的熟悉了之后用VMD!!
6楼2012-06-29 10:17:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

凌风阁少阁主

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by autodockytu at 2012-06-29 10:17:04
初学者用pymol,用的熟悉了之后用VMD!!

有VMD作图的教程吗,求
琴声潇潇,落雨飘飘,滚滚红尘尽烟硝。
8楼2014-12-26 20:21:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

声梦奇缘001

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
8楼: Originally posted by 凌风阁少阁主 at 2014-12-26 20:21:15
有VMD作图的教程吗,求...

这里面有教程,你可以看看http://www.ks.uiuc.edu/Training/Tutorials/
只做不说,明知没地位,坚信有机会
9楼2014-12-27 07:49:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

awaken2013

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

简单一句,pymol做出来的漂亮。。完毕
10楼2014-12-27 13:53:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 qingxueer 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 335求调剂 +13 想上岸呀!! 2026-04-12 13/650 2026-04-12 11:37 by 柴小白
[考研] 电气专硕320求调剂 +6 小麻子111 2026-04-10 6/300 2026-04-12 10:54 by lemon6009
[考研] 313求调剂 +5 余摆摆是大哥 2026-04-11 5/250 2026-04-12 10:34 by 猪会飞
[考研] 计算机22408 281分,求调剂 +7 17715607211 2026-04-06 7/350 2026-04-12 00:43 by xuxiang
[考研] 考研求调剂 +3 ban班小七 2026-04-11 3/150 2026-04-11 20:48 by may_新宇
[考研] 271求调剂 +21 2261744733 2026-04-11 21/1050 2026-04-11 20:19 by Angchemist
[考研] 282,求调剂 +12 jggshjkkm 2026-04-09 14/700 2026-04-11 09:39 by 猪会飞
[考研] 281求调剂 +11 觉得好的吧 2026-04-10 11/550 2026-04-11 09:35 by 逆水乘风
[考研] 263能源动力专硕求调剂 +4 加大号饭盒袋 2026-04-10 4/200 2026-04-10 20:52 by gong120082
[考研] 368求调剂 +3 17385968172 2026-04-10 3/150 2026-04-10 20:12 by 电子奥德彪
[考研] 292求调剂 +9 笑笑袁 2026-04-09 9/450 2026-04-10 10:05 by LHGeng
[考博] 博士自荐 +7 可可小胖 2026-04-08 7/350 2026-04-10 08:28 by kimhero
[考研] 本科211 工科085400 280分求调剂 可跨专业 +3 LZH(等待调剂中 2026-04-09 3/150 2026-04-09 21:29 by wutongshun
[考研] 一志愿武理车辆 281 求调剂 +5 上岸研究生. 2026-04-07 5/250 2026-04-09 15:56 by only周
[考研] 086000生物与医药调剂 +7 awwwwwooooo 2026-04-09 7/350 2026-04-09 13:31 by 北极159263
[考研] 考研求调剂 +4 雯??? 2026-04-08 4/200 2026-04-08 21:44 by 土木硕士招生
[考研] 327求调剂 +12 Xxjc1107. 2026-04-06 12/600 2026-04-08 16:46 by luoyongfeng
[考研] 328求调剂 +4 ghhh88888 2026-04-06 5/250 2026-04-07 14:45 by ghhh88888
[考研] 307求调剂 +3 所念及所望 2026-04-06 3/150 2026-04-06 17:30 by 土木硕士招生
[考研] 308求调剂 +3 终不似从前 2026-04-05 3/150 2026-04-05 20:07 by 啵啵啵0119
信息提示
请填处理意见