24小时热门版块排行榜    

查看: 5274  |  回复: 11

qingxueer

金虫 (初入文坛)

[求助] PYMOL与VMD作图的区别 已有2人参与

请哪位同学告诉我一下PYMOL与 VMD蛋白的三维图有什么区别吗?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

caixin5120

木虫 (正式写手)


【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zh1987hs: 金币+3, 菜兄说的在理~ 2012-06-28 09:23:39
VMD除了pymol能实现的作图功能外还可以观看和计算动力学得到的结果。
pymol当然也有其优势,简单易学。其插件可以进分子对接,电荷,电子云分布等计算。

各有其优点,但总体上说,VMD更强悍。
4楼2012-06-28 09:08:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

see_uok

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

个人感觉pymol图形显示能力更好很多文章都用它来做图,VMD的Movie功能更强大
7楼2012-09-11 09:39:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

wohaihao

荣誉版主 (著名写手)

保密局的……

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
一直都在用pymol感觉还不错,没用过vmd
从小到大就没清闲过,要不就是穷,穷的活着没意思,要不就是累,累得活着没意思,现在是又穷又累了
2楼2012-06-28 00:07:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-06-28 09:08:27
这些都是可以实现三维图形显示的软件,好看与否与你的设置有关,从原理上来说,都可以画出蛋白的三维结构,蛋白与小分子的结合构象等等,这些都是共同的~
3楼2012-06-28 08:06:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qingxueer

金虫 (初入文坛)

哦  谢谢大家啊
5楼2012-06-28 21:07:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

autodockytu

捐助贵宾 (小有名气)


初学者用pymol,用的熟悉了之后用VMD!!
6楼2012-06-29 10:17:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

凌风阁少阁主

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by autodockytu at 2012-06-29 10:17:04
初学者用pymol,用的熟悉了之后用VMD!!

有VMD作图的教程吗,求
琴声潇潇,落雨飘飘,滚滚红尘尽烟硝。
8楼2014-12-26 20:21:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

声梦奇缘001

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
8楼: Originally posted by 凌风阁少阁主 at 2014-12-26 20:21:15
有VMD作图的教程吗,求...

这里面有教程,你可以看看http://www.ks.uiuc.edu/Training/Tutorials/
只做不说,明知没地位,坚信有机会
9楼2014-12-27 07:49:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

awaken2013

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

简单一句,pymol做出来的漂亮。。完毕
10楼2014-12-27 13:53:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 qingxueer 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 生物学一志愿985,分数349求调剂 +4 zxts12 2026-03-21 4/200 2026-03-22 07:20 by ilovexiaobin
[考研] 化学工程321分求调剂 +18 大米饭! 2026-03-15 22/1100 2026-03-21 20:20 by HH领袖
[考研] 一志愿南大,0703化学,分数336,求调剂 +3 收到VS 2026-03-21 3/150 2026-03-21 18:42 by 学员8dgXkO
[考研] 278求调剂 +9 烟火先于春 2026-03-17 9/450 2026-03-21 17:47 by 学员8dgXkO
[考研] 0703化学297求调剂 +3 Daisy☆ 2026-03-20 3/150 2026-03-21 17:45 by ColorlessPI
[考研] 材料 271求调剂 +5 展信悦_ 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:29 by 学员8dgXkO
[考研] 277材料科学与工程080500求调剂 +6 自由煎饼果子 2026-03-16 6/300 2026-03-21 17:21 by 学员8dgXkO
[考研] 求调剂 +3 白QF 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:12 by zhukairuo
[考研] 265求调剂 +3 Jack?k?y 2026-03-17 3/150 2026-03-21 03:17 by JourneyLucky
[考研] 307求调剂 +10 冷笙123 2026-03-17 10/500 2026-03-21 01:54 by JourneyLucky
[考研] 304求调剂 +6 曼殊2266 2026-03-18 6/300 2026-03-21 00:32 by JourneyLucky
[考研] 274求调剂 +10 S.H1 2026-03-18 10/500 2026-03-20 23:51 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工 322求调剂 +4 然11 2026-03-19 4/200 2026-03-20 22:12 by luoyongfeng
[考研] 350求调剂 +5 weudhdk 2026-03-19 5/250 2026-03-20 22:04 by luoyongfeng
[考研] 求调剂一志愿南京航空航天大学289分 +3 @taotao 2026-03-19 3/150 2026-03-20 21:34 by JourneyLucky
[考研] 收复试调剂生 +4 雨后秋荷 2026-03-18 4/200 2026-03-18 14:16 by elevennnne
[考研] 293求调剂 +11 zjl的号 2026-03-16 16/800 2026-03-18 08:10 by zhukairuo
[考研] 275求调剂 +4 太阳花天天开心 2026-03-16 4/200 2026-03-17 10:53 by 功夫疯狂
[考研] 考研调剂 +3 淇ya_~ 2026-03-17 5/250 2026-03-17 09:25 by Winj1e
[考研] 333求调剂 +3 文思客 2026-03-16 7/350 2026-03-16 18:21 by 文思客
信息提示
请填处理意见