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qingxueer

金虫 (初入文坛)

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[求助] PYMOL与VMD作图的区别已有2人参与

请哪位同学告诉我一下PYMOL与 VMD蛋白的三维图有什么区别吗？

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1楼 2012-06-27 22:00:02

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see_uok

金虫 (初入文坛)

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【答案】应助回帖

个人感觉pymol图形显示能力更好很多文章都用它来做图，VMD的Movie功能更强大

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7楼2012-09-11 09:39:48

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wohaihao

荣誉版主 (著名写手)

保密局的……

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【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1

一直都在用pymol感觉还不错，没用过vmd

从小到大就没清闲过，要不就是穷，穷的活着没意思，要不就是累，累得活着没意思，现在是又穷又累了

2楼2012-06-28 00:07:19

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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

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【答案】应助回帖

★ ★
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chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-06-28 09:08:27

这些都是可以实现三维图形显示的软件，好看与否与你的设置有关，从原理上来说，都可以画出蛋白的三维结构，蛋白与小分子的结合构象等等，这些都是共同的~

3楼2012-06-28 08:06:24

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caixin5120

木虫 (正式写手)

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【答案】应助回帖

★ ★ ★
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zh1987hs: 金币+3, 菜兄说的在理~ 2012-06-28 09:23:39

VMD除了pymol能实现的作图功能外还可以观看和计算动力学得到的结果。
pymol当然也有其优势，简单易学。其插件可以进分子对接，电荷，电子云分布等计算。

各有其优点，但总体上说，VMD更强悍。

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4楼2012-06-28 09:08:03

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