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WSW_Alone

木虫 (著名写手)

[求助] 试剂盒提取细菌DNA后,跑胶检测有条带,但是PCR后却无扩增产物。

如题,土壤筛选的菌,用试剂盒提取DNA后,跑胶检测(如图)有条带,进行16S rDNA PCR扩增,结果却没有。请教一下哪里出了问题?(注:上一批也是这么做的,大部分都跑出来了,不知道为何这次都没出来,条件什么的都一样)
体系是通用的,我用的引物是27f/1492r
扩增条件:94℃    5min
                94℃    45s
                56℃    45s
                72℃    90s
                 32个循环
          72℃    20min
求大神指导,不胜感激。

试剂盒提取DNA后直接跑胶检测结果



PCR产物跑胶结果
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處世樹為模,本固任從枝葉動;立身錢作樣,內方還要外邊圓。
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WSW_Alone

木虫 (著名写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by momimiao at 2017-01-15 21:37:54
pcr跑不出来加一  楼主找到原因了吗

设置阳性对照和空白对照(排除试剂失效或污染的情况)
如果扩增不出来再对退火温度进行梯度实验,确定一个合适的温度(可以扩增,且非特异性扩增少)
还不行的话考虑加些增强剂或直接用premix(我后面基本上用预混液了。

发自小木虫IOS客户端
處世樹為模,本固任從枝葉動;立身錢作樣,內方還要外邊圓。
10楼2017-01-16 08:39:48
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