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【求助】ICSD结构数据SOF的意义！
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*data for ICSD #41140 Coll Code 41140 Rec Date 1999/11/30 Mod Date 2008/02/01 Chem Name Copper(I) Selenide - Low Structured Cu2 Se Sum Cu2 Se1 ANX A2X Min Name Berzelianite D(calc) 7.41 Title X-ray study of the average structure of Cu2 Se and of Cu1.8 S in the room temperature and high temperature phases Author(s) Yamamoto, K.;Kashida, S. Reference Journal of Solid State Chemistry (1991), 93, 202-211 Golden Book of Phase Transitions, Wroclaw (2002), 1, 1-123 Unit Cell 5.694(7) 5.694(7) 5.694(7) 90. 90. 90. Vol 184.61 Z 4 Space Group F m -3 m SG Number 225 Cryst Sys cubic Pearson cF12 Wyckoff f c a R Value 0.065 Red Cell F 4.026 4.026 4.026 60 60 60 46.152 Trans Red 0.500 0.500 0.000 / 0.000 0.500 0.500 / 0.500 0.000 0.500 Comments Antifluorite type Stable above 471 K (2nd ref., Tomaszewski), 396-471 K: F4- 3m, m.p. 1400 K AE: Cu1: Se4; Cu2; Se3; Se: Cu8 Compound with mineral name: Berzelianite The structure has been assigned a PDF number (experimental powder diffraction data): 46-1129 Structure type prototype : Cu2Se Temperature in Kelvin: 293 Structure type : Cu2Se X-ray diffraction from single crystal Atom # OX SITE x y z SOF H ITF(U) Se 1 -2 4 a 0 0 0 1. 0 0.039(2) Cu 1 +1 8 c 0.25 0.25 0.25 0.37(7) 0 0.068(14) Cu 2 +1 32 f 0.334(5) 0.334 0.334 0.158(28) 0 0.085(12) *end for ICSD #41140 上面试Cu2Se的结构数据。问题：倒数第三行和倒数第二行，有两行SOF（site of fractional?)为分数的Cu原子坐标行。这个原胞中，Se的Site为4a, Cu 1 的site为8c，这个比例不是已经符合Cu:Se=2:1的比例了吗？为什么还会测出Ce 2的32 f？这个数据真实反映了Cu2Se中Cu:Se=2:1的组分特征吗？ 对于这里的两行Cu原子， 8×0.37+32 ×0.158=8.02, 基本上也是符合Cu:Se=2:1的。这种小于1的SOF怎么体现在真实晶体结构中的呢？  Cu2Se结构模型 [ Last edited by cenwanglai on 2012-6-19 at 15:45 ] |
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大神，想问下你在生成的Cu2 Se1的坐标是这样么？但是坐标里面Cu和Se比例不对，这样的坐标可以直接提交到vasp里算吗？ Cu2Se 1.0 5.6939997673 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 5.6939997673 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 5.6939997673 Se Cu 4 40 Direct 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 0.500000000 0.500000000 0.500000000 0.000000000 0.500000000 0.500000000 0.500000000 0.000000000 0.250000000 0.250000000 0.250000000 0.750000000 0.750000000 0.750000000 0.750000000 0.750000000 0.250000000 0.250000000 0.250000000 0.750000000 0.750000000 0.250000000 0.750000000 0.250000000 0.750000000 0.250000000 0.250000000 0.750000000 0.750000000 0.750000000 0.250000000 0.250000000 0.333999991 0.333999991 0.333999991 0.666000009 0.666000009 0.666000009 0.666000009 0.666000009 0.333999991 0.333999991 0.333999991 0.666000009 0.666000009 0.333999991 0.666000009 0.333999991 0.666000009 0.333999991 0.333999991 0.666000009 0.666000009 0.666000009 0.333999991 0.333999991 0.333999991 0.833999991 0.833999991 0.666000009 0.166000009 0.166000009 0.666000009 0.166000009 0.833999991 0.333999991 0.833999991 0.166000009 0.666000009 0.833999991 0.166000009 0.333999991 0.166000009 0.833999991 0.333999991 0.166000009 0.166000009 0.666000009 0.833999991 0.833999991 0.833999991 0.333999991 0.833999991 0.166000009 0.666000009 0.166000009 0.166000009 0.666000009 0.833999991 0.833999991 0.333999991 0.166000009 0.166000009 0.333999991 0.166000009 0.833999991 0.666000009 0.833999991 0.833999991 0.666000009 0.166000009 0.166000009 0.333999991 0.833999991 0.833999991 0.833999991 0.333999991 0.166000009 0.166000009 0.666000009 0.166000009 0.166000009 0.333999991 0.833999991 0.833999991 0.666000009 0.166000009 0.833999991 0.666000009 0.833999991 0.166000009 0.333999991 0.833999991 0.166000009 0.666000009 0.166000009 0.833999991 0.333999991 |
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
cenwanglai: 金币+5, 非常感谢。我是做第一性原理计算模拟，碰到分数占据的晶体结构，建模非常困难。你的回复对我非常有帮助~ 2012-06-19 15:41:51
lijunjie84: 金币+1, 斑斑辛苦了！ 2012-11-15 13:51:33
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你的第二种分析是对滴 site代表的是晶体学中威克夫位置，sof代表的是原子在这个位置的占有率，一般理想的情况sof应该为1（即100%），但是由于合成条件或者晶体本身存在缺陷，所以在这些位点存在部分占据的情况（即占有率小于1），这些在一般的晶体学结构解析的时候可以发现，在解析这些原子位点的时候温度因子异常的高，所以必须使用部分占据的命令进行精修，所以可以得到精修的占有率，所以计算的时候总的原子数应该是占有率*威克夫位点前面的数字，这些同类原子的计算之和才是分子式的下标数字，所以你的第二种分析是对的，结果虽然和理想值有点偏差，这是正常的，因为精修的时候并没有考虑化合价平衡的问题。 而这种无序的现象存在的晶体在性能上往往有比较有趣的现象，比如你举的例子Cu2-XSe,由于Cu原子的无序，导致有较好的热电性能，该研究最近在Nature已经发表。 |
3楼2012-06-19 15:14:20
4楼2012-06-19 15:40:17
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
cenwanglai: 金币+5, 谢谢提供链接~ 2012-06-19 20:44:51
linhua0402313: 金币+1, 感谢版主热心参与，我说的就是这篇文献，辛苦了 2012-06-19 21:56:14
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linhua0402313: 金币+1, 感谢版主热心参与，我说的就是这篇文献，辛苦了 2012-06-19 21:56:14
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可以参看这篇 Copper ion liquid-like thermoelectrics http://www.nature.com/nmat/journal/v11/n5/full/nmat3273.html 通讯作者是上硅所的Xun Shi or Lidong Chen |
5楼2012-06-19 19:32:24
