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如何使用blast建立本地数据库（我下了很多fasta文件存放在一个文件夹里）
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在HMP数据库里下了很多菌株的序列 想找一种酶的同源基因 用blast2.2.26+时首先要makeblastdb 一般-in 后指向的是一个文件的路径 但我现在有很多fasta文件存放在一个文件夹里（因为下载的时候是分开在NCBI里下的） 所以我是不是要把这1.5GB的文件合并到一个fasta中再blast 还是有更好的方法直接使用文件夹的路径就可以建立本地数据库了呢 [ Last edited by ldy2140 on 2012-6-5 at 10:33 ] |
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