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VMD不显示小分子
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| 我用Gromacs跑完动力学之后，想看一下小分子的作用位点，但是用VMD导入之后为什么没有小分子的结构，只有蛋白的........哪位高手指点一下......... |
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Tanya_snail
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2楼2012-05-29 23:26:39
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caixin5120 
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你可以在VMD 中不同的分子用不同的显示方式，下面是我做模拟，用VMD 做漂亮显示的一段脚本，你可以参考，把这一段看懂了，你自己就会调节了 mol delrep 0 top display Orthographic color Display Background white color Resname TIP3 green #color Resname POT yellow #color Resname CLA blue color Resname GRA cyan color Resname ADE blue color Resname THY red mol representation VDW 1.5 23 mol color ResName mol selection {resname TIP3} mol addrep top mol representation VDW 1.5 23 mol color Name mol selection {resname POT CLA} mol addrep top mol representation Licorice 0.3 60 60 mol color ResName mol selection {resname GRA} mol addrep top mol representation NewCartoon mol color ResName mol selection {resname ADE THY} mol addrep top |
5楼2012-05-30 10:15:47
visualization
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