应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 已知秀丽隐杆线虫的引物序列，如何得到所扩增片段的长度
51/1返回列表
查看: 2402  |  回复: 11
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

20111987

金虫 (正式写手)

[求助] 已知秀丽隐杆线虫的引物序列，如何得到所扩增片段的长度

已知秀丽隐杆线虫的引物序列，如何得到所扩增片段的长度？
引物如下：
skn-1
5′-AGTGTCGGCGTTCCAGATTTC-3′；
5′-GTCGACGAATCTTGCGAATCA-3′；

sod-3
5'-CCAACCAGCGCTGAAATTCAATGG
5'-GGAACCGAAGTCGCGCTTAATAGT

daf-16(NM_001026247),
5′-TTTCCGTCCCCGAACTCAA-3′ ;
5′-ATTCGCCAACCCATGATGG-3′;       

hsp-16.2
5′-ACGCCAATTTGCTCCAGTCT-3′,
5′-GATGGCAAACTTTTGATCATTGTTA-3′;

ama-1       
5′-CTGACCCAAAGAACACGGTGA-3′
5′-TCCAATTCGATCCGAAGAAGC-3′

akt-2
5′-TTGTAAAACGACGGCCAG
5′-CATGATTACGCCAAGCTC

tub-1
5′-TCCAATTGCTCAACCACG-3′,
5′-AGGGAGTACTTCACTTGG-3′
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-05-28 08:15:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hongqifei

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
20111987: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2012-05-28 15:31:23
amisking: 回帖置顶 2012-05-28 20:30:54
UCSC的In-Silico PCR。物种选C.elegans，后面输入引物序列即可。
链接在此：
http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/h ... amp;hgsid=273515433
赞一下(2人) 回复此楼
何须剑道争锋？千人指，万人封，可问江湖鼎峰，三尺秋水尘不染，天下无双。
4楼2012-05-28 12:47:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

niushuaiji

金虫 (正式写手)

不放弃的小鸟

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
20111987: 金币+5, ★有帮助 2012-05-28 15:30:32
NCBi的oncogene输入查询基因的名称，找到一系列相关基因，再用去除酶切位点的引物序列按对分别比对！

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
赞一下 回复此楼
Tobeornottobe,that'saproblem
2楼2012-05-28 09:10:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

duzhichao

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
20111987: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-05-28 15:31:02
amisking: 回帖置顶 2012-05-28 20:30:52
找到pubmed中Nucleotide界面，点击左侧工具条内的BLAST，进入blast界面，选择Nucleotide板块中的Search for short, nearly exact matches ，在Search 提供的空白区键入 上游（5‘-3’）nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn（20个以上的n）下游引物（5‘-3’），在其他选框中进行必要的限定。点击blast按钮。待进入下一界面后点击format, 待出现下一界面后，察看其中上下游引物能100%互补序列，用目的序列的最大碱基位置-最小碱基位置+1即目的片段的长度。需要补充说明的是，统一引物可能会blast到多条pcr产物，但目的片段的大小一致，主要是同一基因，有些提供的序列不完整造成的。 你试试。
赞一下 回复此楼
天道酬勤！
3楼2012-05-28 11:12:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

20111987

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by hongqifei at 2012-05-28 12:47:34
UCSC的In-Silico PCR。物种选C.elegans，后面输入引物序列即可。
链接在此：
http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgPcr?wp_target=&db=0&org=C.+elegans&wp_f=&wp_r=&wp_size=4000&wp_perfe ...

非常感谢(⊙o⊙)哦！提供信息对我帮助很大，不知道楼主是否做过秀丽隐杆线虫的RNA提取，每次大概用多少虫体能提出来RNA呀，提的时候研磨了吗？用的是干虫体还是留少部分液体呢？
赞一下 回复此楼
5楼2012-05-28 15:37:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[有机交流] 二苯甲酮酸类衍生物 50+3 小白爱主人 2026-04-17 6/300 2026-04-17 18:47 by kf2781974
[考研] 335求调剂 +20 想上岸呀！！ 2026-04-12 23/1150 2026-04-17 10:50 by cuisz
[考研] 291求调剂 +9 关忆北. 2026-04-14 9/450 2026-04-16 22:49 by cfdbai
[考研] 化学070300 求调剂 +28 哈哈哈^_^ 2026-04-12 28/1400 2026-04-16 21:36 by 大力水手力大无�
[考研] 0831生医工第一轮调剂失败求助 +14 小熊睿睿_s 2026-04-11 18/900 2026-04-16 20:41 by lpl364211
[考研] 327求调剂 +26 Xxjc1107. 2026-04-13 29/1450 2026-04-16 10:52 by Espannnnnol
[考研] 290调剂生物0860 +38 哇哈哈，。 2026-04-11 44/2200 2026-04-16 09:52 by cuisz
[考研] 279学硕食品专业求调剂院校 20+7 孤独的狼爱吃羊 2026-04-12 29/1450 2026-04-16 09:00 by screening
[考研] 求调剂学校 +14 不会吃肉 2026-04-13 16/800 2026-04-15 21:59 by noqvsozv
[考研] 求调剂 +11 小聂爱学习 2026-04-11 15/750 2026-04-15 21:57 by noqvsozv
[考研] 调剂求收留 +34 果然有我 2026-04-10 35/1750 2026-04-15 13:05 by 西北望—风沙
[考研] 复试调剂 +21 积极向上； 2026-04-10 23/1150 2026-04-15 12:50 by 西北望—风沙
[考研] 211本科材料化工求调剂 +19 YHLAH 2026-04-11 23/1150 2026-04-14 22:25 by fenglj492
[教师之家] 转长聘了 +7 简单化xn 2026-04-13 7/350 2026-04-14 14:50 by xindong
[考研] 300分求调剂 （085501机械专硕，本科扬大） +9 xu@841019 2026-04-11 10/500 2026-04-14 08:48 by 木木mumu～
[考研] 求调剂 +3 我爱高数高数爱� 2026-04-12 3/150 2026-04-14 01:00 by 王珺璞
[考研] 302求调剂 +10 易！? 2026-04-13 10/500 2026-04-13 19:04 by lbsjt
[考研] 材料考研调剂 +29 云木达达 2026-04-11 31/1550 2026-04-13 13:32 by lyh鲁老师
[考研] 0831一轮调剂失败求助 +10 小熊睿睿_s 2026-04-11 10/500 2026-04-12 22:43 by 长弓傲
[考研] 调剂求助 +6 果然有我 2026-04-11 7/350 2026-04-11 16:22 by 明月此时有
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭