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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » AMBER的amberpdb命令出错问题
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903566945

金虫 (正式写手)

[求助] AMBER的amberpdb命令出错问题

用ambpdb -p xx.prmtop < xxmin.rst > xxmin.pdb命令后，出现Fortran runtime error: Bad value during floating point read错误，生成的新pdb是0K，这是怎么回事呢？求高手指教，之前的MD是正常结束的。
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1楼 2012-05-15 16:23:02
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zdgclf

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-06-28 13:56:13
903566945: 金币+5 2012-07-02 09:00:01
有可能是你的top文件生成的不对!我也遇到过，通过重新生成top，然后就可以把rst文件转换成PDB了！
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4楼2012-06-28 11:47:09
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903566945

金虫 (正式写手)
没有人回答一下吗？
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2楼2012-06-06 08:55:40
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mengyan142

木虫 (小有名气)
没遇到过呵呵，其他的都正常的话就不管么，会不会是编译器安的不太对，猜的哈
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3楼2012-06-08 23:02:42
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白云鹤TJY

新虫 (小有名气)
很有可能是你的xx。prmtop文件弄错了，我也遇到过的
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我们之所以战斗，不是为了改变世界，而是为了不让世界改变我们。
5楼2013-04-06 15:48:44
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