| 查看: 2135 | 回复: 7 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
[求助]
请教各位大牛，SYBYL-X中，SURFLEX-DOCK可加两个配体吗？可加水箱进行对接吗？
|
||
|
以前使用SYBYL-X中的SURFLEX-DOCK进行对接时，都是单一受体与一配体分子对接，或者是一对多对接，即高通量虚拟筛选，实则还是一对一对接，只不过是批量进行，都非常顺利。现碰到一些问题，求助各位大老： （1）加完全相同的两个配体时，这两个配体就重叠在了一起。如何使它们不重叠？ （2）受体加水箱后，对接时配体结合到了水箱上，结合不到受体分子上，如何才能使配体对接到受体上？ （3）SYBYL-X对接时可一个受体与两个完全相同的配体同时进行对接吗？我试了一下先对接一个，后对接第二个，但感觉两个相同配体同时加上较好些。 （4）minimization of time-averaged dynamics structure在那个模块？步骤是什么？ 越详细越好，在这里先感谢大家。 |
回复此楼» 猜你喜欢
售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急
已经有7人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急
已经有3人回复
-
明天应该可查了！？
已经有5人回复
-
如果此刻你正在为国基感到焦虑，不妨来听听这首《基金之外》
已经有7人回复
-
没有任何消息-是不是就凉了
已经有8人回复
-
售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有3人回复
-
人气不行了
已经有10人回复
-
我面上完蛋了
已经有10人回复
-
能否退出参与的面上项目解除限项
已经有24人回复
-
filecode，4个jtjc了
已经有17人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- sybyl , 无配体对接
已经有6人回复
- 如何将sybyl对接后的蛋白质和配体保存成一个PDB文件
已经有8人回复
- 分子对接时配体跟受体分开很远，配体不在受体活性口袋
已经有7人回复
- 请教各位有关分子对接的问题
已经有5人回复
- sybyl做分子对接，画的小分子对接不成功
已经有16人回复
- 请教大牛，有关里德堡态
已经有4人回复
- 请教大牛神经网络的过拟合问题
已经有6人回复
- sybyl中的surflex-dock是“半柔性”对接吗？
已经有3人回复
- 请教各位大侠，美国签证蓝色的221G补充材料清单相关事宜
已经有13人回复
- 请教各位老师，腐植酸钠溶液有什么物质可以有效增稠？
已经有11人回复
- 第一次投SCI，请教各位大牛technical check 中的这两条意见是什么意思？
已经有7人回复
- 【求助】醋酸钯和配体可以一起加吗
已经有14人回复
cfmzxf84
木虫 (正式写手)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 5003.4
- 散金: 822
- 红花: 1
- 帖子: 908
- 在线: 328.6小时
- 虫号: 814536
- 注册: 2009-07-23
- 专业: 化学环境污染与健康
5楼2012-05-12 23:29:47
2楼2012-05-10 17:15:25
3楼2012-05-10 18:02:59
Chengxm
至尊木虫 (职业作家)
- 应助: 11 (小学生)
- 金币: 10363.7
- 红花: 3
- 帖子: 3656
- 在线: 372.9小时
- 虫号: 249332
- 注册: 2006-05-06
- 性别: GG
- 专业: 化学生物学与生物有机化学
4楼2012-05-11 10:08:25
20