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连衣裙dress

新虫 (初入文坛)

[求助] 分子优化叠合

请教各位大神,我的课题是甲基喹啉酮乙酸类化合物的3D-QSAR研究。
我用sybyl画好结构图后,要进行分子优化,但是不知道怎么加上电荷,也不清楚怎么进行分子叠合,求详细的sybyl 操作流程。是不是要把分子放在一个数据库内才可以进行叠合??求解答,谢谢各位了
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ky96998

金虫 (小有名气)

★ ★ ★
chaizhm: 金币+3, 很同意你的观点,这种人得好好教育 2012-05-10 11:02:27
典型的不看sybyl操作手册类问题
你的问题都是sybyl最基础的操作问题,说明书上都有具体操作指导,建议自己看操作手册。你所研究的分子集是需要放入一个数据库的,这样方便操作。用MSS打开数据库,compute里面就可以优化分子,加电荷。不过你做的是3D-QSAR研究,一般的能量优化后的构象和活性构象差别可能很大,如果有受体信息,建议基于分子对接来做QSAR
2楼2012-05-10 10:07:43
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