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adili

铁虫 (初入文坛)

[求助] Real-time PCR

各位大侠好！
目前我遇到了一个困难需要帮忙！我选取了实验物种的mtDNACOI基因的一对通用引物，将其PCR扩增以后克隆之后进行测序，序列长度666bp.我从这666bp序列中想筛选这一物种的特异性引物做Real-time PCR ，可由于我的这一物种是最新发现的ncbi上检索不到这一物种序列，只有同一个科的序列，而且这一物种与同一科的另一物种相似性高达96.8%，从而造成设计引物探针都比较困难！我设计了一对特异性不理想我想问一下我该怎么办？是不是应该选取mtDNACOI之外的其他片段从而寻找差异性较大的序列从中设计特异性引物？我该如何寻找这一物种的特异性引物？我将不胜感激
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耐心，细心，信心缺一不可
1楼 2012-04-26 20:24:19
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adili

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by cxfans at 2012-04-27 13:59:38:
可以啊 有很多做检测的就这样

谢谢你
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耐心，细心，信心缺一不可
5楼2012-04-27 22:29:34
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cxfans

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
adili: 金币+1, ★有帮助, 有帮助 2012-04-27 00:27:02
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-04-27 13:35:24
从ITS着手试试吧 公认的很保守
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2012-04-26 22:28:18
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adili

铁虫 (初入文坛)
adili: 回帖置顶 2012-04-27 00:33:54
引用回帖:
2楼: Originally posted by cxfans at 2012-04-26 22:28:18:
从ITS着手试试吧 公认的很保守

谢谢了！发帖子的时候写错了，应该是实时荧光pcr,选择its区可以吗？
赞一下 回复此楼
耐心，细心，信心缺一不可
3楼2012-04-27 00:26:00
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cxfans

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by adili at 2012-04-27 00:26:00:
谢谢了！发帖子的时候写错了，应该是实时荧光pcr,选择its区可以吗？

可以啊 有很多做检测的就这样
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4楼2012-04-27 13:59:38
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