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yuguangyun

新虫 (小有名气)

[求助] 蛋白质-蛋白质对接

各位大侠好,小弟现在做蛋白和受体对接。受体是toll5受体,蛋白质是一植物凝集素。我在对接前先要找出toll5受体的结合位点,请问如何寻找,用ds里面的define binding site 可靠吗,你们是如何做蛋白蛋白对接的。说说操作过程吧》急需啊…………
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学好专业知识
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renjinhong

金虫 (小有名气)


zh1987hs: 金币+1, 谢谢 2012-06-14 20:53:23
可以试试haddock,做大分子对接的
10楼2012-06-14 20:36:26
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yuguangyun

新虫 (小有名气)

自己顶一下
学好专业知识
2楼2012-04-25 19:15:32
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870609

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
zh1987hs: 金币+1, 谢谢 2012-04-26 10:03:50
蛋白蛋白对接应该用zdock,建议你从网上直接找相关的教程照着做
3楼2012-04-26 08:07:55
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yuguangyun

新虫 (小有名气)

谢谢,我是按照ds教程做的。但是教程的作法里面,对节前没有涉及到活性位点的事情,而且我拿对接后的其中一个POSE跑了动力学,跑到第一步就出错了……不知道什么原因
学好专业知识
4楼2012-04-26 13:37:40
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