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忆-雪

银虫 (小有名气)

[求助] 急求RT-PCR电泳图分析已有1人参与

急求各位高手忙我分析分析这是什么原因,第一张和第3张图右边的条带呈涂抹状,这是为什么?
图1:退火温度55度,为什么与marker相邻的两孔目的条带上下有条带,而另外两空却没有?(前两空和后两空模板合成时间不一样,后两孔模板合成快1周了,前两空是今天合成的。)
图2:退火温度58度,为什么后面几个条带呈涂抹状,是因为退火温度太高了吗?内参条带很亮,内参条带旁边的两空的条带跟我参考的文献片段长短不一样,文献报道是266bp,而我扩增出来的是300多bp,我合成的引物跟文献完全一致,这是为什么,难道这不是我的目的基因吗?我重复试验3次,结果都一样。
图3:退火温度48度,结果同图2后面条带一致,呈涂抹状,我试过50度,55度,结果都是涂抹状,这是为什么?
扩增体系是20ul,其中引物1ul,cDNA2ul
PCR条件:94度,5min;94度 30s;退火温度上述温度;72度45s,循环30次,72度 7min.

现在很是惆怅,希望各位高手帮我这菜鸟分析分析!

内参图,退火温度55度



内参和样品图



48度样品图
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xujiemeng09

金虫 (正式写手)

引用回帖:
11楼: Originally posted by 忆-雪 at 2012-03-31 10:18:29:
后面实验的时候放内参了,每次内参都出来,查看文献的引物没有做BLAST,我是个初学者,也不是这个专业的,不是很清楚该怎样做,一直是自己摸索着做的,多谢你的提醒哈。我的内参cDNA加0.5ul就出来很亮的条带了, ...

换引物试试
你若不想做,会找到一个借口;你若想做,会找到一个方法。
13楼2012-04-01 02:57:18
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