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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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欢仔

银虫 (正式写手)

[求助] 引物退火温度

大家好 我自己设计引物,引物合成单上的温度是63.8度 和 55.41度,在PCR扩增时我的退火温度怎么设计呢,是这两个温度的平均温度吗
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勇于尝试新鲜事物
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atlanticwi

金虫 (正式写手)

琴美喜欢发呆 不喜欢发脾气

★ ★
西瓜: 金币+2, Good! 2012-03-28 10:24:30
引用回帖:
5楼: Originally posted by 欢仔 at 2012-03-26 17:05:44:
哦……我试试吧,如果试了好几个温度,都出不来,是不是就说明引物有问题
还有个问题  电泳可以检测CDNA的好坏吗? 我做了,但是不知道结果是什么意思

嗯..........
要你设计时就要Tm值相差不能超过2到4度的,是按照设计软件给出的条件来做的,如我设计时F/R Primer Tm都是54度,而给出单子上写的F Tm 53.6 R Tm 47.7 ............Tm还和你结合模板上下游的结构有关系,所以引物单子是不准的,按你设计的来,若你设计的还相差这么大,就按楼上战友的方法来做吧
祝实验顺利
Let God do with it as He wills
6楼2012-03-26 17:17:58
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susizheng

木虫 (著名写手)

我們是糖 甜到憂傷

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我一般先用低的温度作为Tm扩增,不行的话,再做梯度,不过一般只要引物没问题,选择低的那个都能扩出来。
Thank-you,so-blue.
3楼2012-03-26 16:38:18
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欢仔

银虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by atlanticwi at 2012-03-26 16:37:48:
嗯...............
首先,不要看引物单子的Tm值,引物单子Tm值是有条件的,比如Na离子浓度等。
然后,你拿什么软件设计的引物,就按那个软件给出你的Tm值来设定退火

这么做有效果没,我软件给出的温度相差有点大
勇于尝试新鲜事物
4楼2012-03-26 17:03:16
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欢仔

银虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by susizheng at 2012-03-26 16:38:18:
我一般先用低的温度作为Tm扩增,不行的话,再做梯度,不过一般只要引物没问题,选择低的那个都能扩出来。

哦……我试试吧,如果试了好几个温度,都出不来,是不是就说明引物有问题
还有个问题  电泳可以检测CDNA的好坏吗? 我做了,但是不知道结果是什么意思
勇于尝试新鲜事物
5楼2012-03-26 17:05:44
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