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用16S扩V6-V8区总是拖尾并出现非特异性扩增怎么办?
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金陵小南
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虫号: 969940
注册: 2010-03-13
专业: 环境微生物学
[
求助
]
用16S扩V6-V8区总是拖尾并出现非特异性扩增怎么办?
问题如题,退火温度提高过也降低多,循环次数也减少过,DNA模板也稀释过,都不大管用,希望哪位高手能给予指点!
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1楼
2012-03-16 09:37:14
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zhaoghit
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专业: 环境微生物学
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西瓜: 金币+2, 鼓励交流!
2012-03-18 17:51:59
你是要增加特异性,为什么减少循环数啊,增加循环数才能使得特异性更强。我建议你先把DNA纯化下,用纯化试剂盒。你选择降落扩增也可以,这样效果能好些。循环数不要降。你在体系里面加些BSA会有帮助。PCR能扩出来理想的产物
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2楼
2012-03-18 11:17:09
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金陵小南: 金币+10
2012-04-06 08:00:16
引用回帖:
2楼
:
Originally posted by
zhaoghit
at 2012-03-18 11:17:09:
你是要增加特异性,为什么减少循环数啊,增加循环数才能使得特异性更强。我建议你先把DNA纯化下,用纯化试剂盒。你选择降落扩增也可以,这样效果能好些。循环数不要降。你在体系里面加些BSA会有帮助。PCR ...
循环数少的话,非特异扩增的量也少些吧。
降落PCR和BSA都是好方法啊。
个人觉得直接换引物可能更省事。另外,也可以考虑下巢式PCR。
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3楼
2012-03-18 17:53:52
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