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金陵小南

新虫 (初入文坛)

[求助] 用16S扩V6-V8区总是拖尾并出现非特异性扩增怎么办?

问题如题,退火温度提高过也降低多,循环次数也减少过,DNA模板也稀释过,都不大管用,希望哪位高手能给予指点!
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zhaoghit

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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西瓜: 金币+2, 鼓励交流! 2012-03-18 17:51:59
你是要增加特异性,为什么减少循环数啊,增加循环数才能使得特异性更强。我建议你先把DNA纯化下,用纯化试剂盒。你选择降落扩增也可以,这样效果能好些。循环数不要降。你在体系里面加些BSA会有帮助。PCR能扩出来理想的产物
天道酬勤!
2楼2012-03-18 11:17:09
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)

【答案】应助回帖

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金陵小南: 金币+10 2012-04-06 08:00:16
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhaoghit at 2012-03-18 11:17:09:
你是要增加特异性,为什么减少循环数啊,增加循环数才能使得特异性更强。我建议你先把DNA纯化下,用纯化试剂盒。你选择降落扩增也可以,这样效果能好些。循环数不要降。你在体系里面加些BSA会有帮助。PCR ...

循环数少的话,非特异扩增的量也少些吧。
降落PCR和BSA都是好方法啊。
个人觉得直接换引物可能更省事。另外,也可以考虑下巢式PCR。
3楼2012-03-18 17:53:52
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