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zhangji3013金虫 (小有名气)
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NBO分析笼状结构
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| 用gaussian作NBO分析,看碳硼笼里碳的成键形式,C应该是跟相邻的5个B都有键合,但是NBO只给出其中2,3个,距离稍远的B,NBO分析就没有键合,计算的基组已经比较大了6-311++G**,不知道是有成键显示的阈值,还是NBO分析就断定距离较远的两个原子没有成键。 |
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zhou2009: 金币+3 2012-03-21 20:25:14
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如果你非要让那几个没出现的键出现,就利用$CHOOSE选项,自行设定lewis图样(BD连接关系)。但是这些原本没出现的BD肯定占据数比较低。 笼状结构可能存在明显多中心键,强行以双中心键形式来分析,可能解释不清体系的电子结构本质。 |
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7楼2012-03-15 13:51:31
2楼2012-03-14 16:20:55
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【答案】应助回帖
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zhou2009: 金币+3 2012-03-21 20:24:46
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zhou2009: 金币+3 2012-03-21 20:24:46
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这和距离没有绝对关系。NBO程序会自动对每一对儿原子间搜索BD,如果BD的占据数高于阈值(比如1.9),那么就被认为是成键了。 如果找不到BD,某种程度上表明相应的键偏弱。在NBO模块中加入DETAIL关键词就可以看到具体的BD搜索过程。 基组对NBO分析结果影响不大,尤其是弥散函数影响甚微,6-31G*级别通常就够了。 |
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3楼2012-03-14 17:20:49
zhangji3013
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zhangji3013
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