24小时热门版块排行榜    

查看: 2049  |  回复: 11

zhangji3013

金虫 (小有名气)

[求助] NBO分析笼状结构

用gaussian作NBO分析,看碳硼笼里碳的成键形式,C应该是跟相邻的5个B都有键合,但是NBO只给出其中2,3个,距离稍远的B,NBO分析就没有键合,计算的基组已经比较大了6-311++G**,不知道是有成键显示的阈值,还是NBO分析就断定距离较远的两个原子没有成键。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


★ ★ ★
zhou2009: 金币+3 2012-03-21 20:25:14
引用回帖:
5楼: Originally posted by zhangji3013 at 2012-03-15 10:12:55:
多谢,请问这个阈值可以再改小吗?

如果你非要让那几个没出现的键出现,就利用$CHOOSE选项,自行设定lewis图样(BD连接关系)。但是这些原本没出现的BD肯定占据数比较低。
笼状结构可能存在明显多中心键,强行以双中心键形式来分析,可能解释不清体系的电子结构本质。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

7楼2012-03-15 13:51:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

xihuanhuan

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhangji3013: 金币+20, ★★★很有帮助 2012-03-15 10:13:28
如果两个原子的距离大于它所能成键的最大距离,那么它就不会成键,所以你应该让它和碳离得近些,在成键范围之内
2楼2012-03-14 16:20:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhou2009: 金币+3 2012-03-21 20:24:46
这和距离没有绝对关系。NBO程序会自动对每一对儿原子间搜索BD,如果BD的占据数高于阈值(比如1.9),那么就被认为是成键了。
如果找不到BD,某种程度上表明相应的键偏弱。在NBO模块中加入DETAIL关键词就可以看到具体的BD搜索过程。
基组对NBO分析结果影响不大,尤其是弥散函数影响甚微,6-31G*级别通常就够了。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2012-03-14 17:20:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangji3013

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xihuanhuan at 2012-03-14 16:20:55:
如果两个原子的距离大于它所能成键的最大距离,那么它就不会成键,所以你应该让它和碳离得近些,在成键范围之内

没有办法,优化的结构就是这样,碳硼笼里C的成键数大于4,所以有些键就是弱些,距离较远,一直理论上用离域轨道分析,但是我想看具体每个键的信息,NBO分析就认为那些距离较远的一点键合没有,所以困扰
4楼2012-03-15 10:11:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangji3013

金虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by sobereva at 2012-03-14 17:20:49:
这和距离没有绝对关系。NBO程序会自动对每一对儿原子间搜索BD,如果BD的占据数高于阈值(比如1.9),那么就被认为是成键了。
如果找不到BD,某种程度上表明相应的键偏弱。在NBO模块中加入DETAIL关键词就可以看到 ...

多谢,请问这个阈值可以再改小吗?
5楼2012-03-15 10:12:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangji3013

金虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
: Originally posted by sobereva at 2012-03-14 17:20:49:
这和距离没有绝对关系。NBO程序会自动对每一对儿原子间搜索BD,如果BD的占据数高于阈值(比如1.9),那么就被认为是成键了。
如果找不到BD,某种程度上表明相应的键偏弱。在NBO模块中加入DETAIL关键词就可以看到 ...

点快了,把金币全部给一楼了,sobereva
不好意思了
6楼2012-03-15 10:19:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangji3013

金虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by sobereva at 2012-03-15 13:51:31:
如果你非要让那几个没出现的键出现,就利用$CHOOSE选项,自行设定lewis图样(BD连接关系)。但是这些原本没出现的BD肯定占据数比较低。
笼状结构可能存在明显多中心键,强行以双中心键形式来分析,可能解释不清 ...

谢谢!
8楼2012-03-15 17:00:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ZJboy

木虫 (著名写手)

内容已删除
9楼2012-08-19 22:08:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


内容已删除
10楼2012-08-20 00:44:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zhangji3013 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 复试调剂 +4 z1z2z3879 2026-03-14 6/300 2026-03-19 17:18 by fei626-918
[考研] 本人考085602 化学工程 专硕 +17 不知道叫什么! 2026-03-15 19/950 2026-03-19 15:06 by 尽舜尧1
[考研] 0703化学调剂 +5 pupcoco 2026-03-17 8/400 2026-03-19 13:58 by houyaoxu
[考研] 344求调剂 +6 knight344 2026-03-16 7/350 2026-03-18 20:13 by walc
[考研] 一志愿武理材料305分求调剂 +5 想上岸的鲤鱼 2026-03-18 6/300 2026-03-18 17:53 by 无际的草原
[考研] 08工科 320总分 求调剂 +5 梨花珞晚风 2026-03-17 5/250 2026-03-18 14:49 by haxia
[考研] 0854可跨调剂,一作一项核心论文五项专利,省、国级证书40+数一英一287 +8 小李0854 2026-03-16 8/400 2026-03-18 14:35 by 搏击518
[考研] 312求调剂 +8 陌宸希 2026-03-16 9/450 2026-03-18 12:39 by Linda Hu
[考博] 环境领域全国重点实验室招收博士1-2名 +3 QGZDSYS 2026-03-13 5/250 2026-03-18 11:13 by QGZDSYS
[考研] 293求调剂 +11 zjl的号 2026-03-16 16/800 2026-03-18 08:10 by zhukairuo
[考研] 283求调剂 +3 听风就是雨; 2026-03-16 3/150 2026-03-17 07:41 by 热情沙漠
[考研] 药学383 求调剂 +3 药学chy 2026-03-15 4/200 2026-03-16 20:51 by 元子^0^
[考研] 机械专硕325,寻找调剂院校 +3 y9999 2026-03-15 5/250 2026-03-16 19:58 by y9999
[考研] 304求调剂 +4 ahbd 2026-03-14 4/200 2026-03-16 16:48 by 我的船我的海
[考研] 0856求调剂 +3 刘梦微 2026-03-15 3/150 2026-03-16 10:00 by houyaoxu
[考研] 327求调剂 +6 拾光任染 2026-03-15 11/550 2026-03-15 22:47 by 拾光任染
[考研] 22408总分284求调剂 +3 InAspic 2026-03-13 3/150 2026-03-15 11:10 by zhq0425
[考研] 085601材料工程315分求调剂 +3 yang_0104 2026-03-15 3/150 2026-03-15 10:58 by peike
[考研] 080500,材料学硕302分求调剂学校 +4 初识可乐 2026-03-14 5/250 2026-03-14 21:08 by peike
[基金申请] 现在如何回避去年的某一个专家,不知道名字 +3 zk200107 2026-03-12 6/300 2026-03-14 17:13 by zk200107
信息提示
请填处理意见