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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » ADF/Dalton » 【讨论】ADF NBO有这么慢吗？
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wtscrystal

银虫 (小有名气)

[交流] 【讨论】ADF NBO有这么慢吗？ 已有3人参与

我自己编译了一个NBO standalone: gennbo.exe, 放到：/opt/adf200901/bin下
然后测试：
/opt/adf200901/examples/adf/H2O_ADFNBO中的NBO计算，结果显示：

*********************************** NBO 5.G ***********************************
             N A T U R A L   A T O M I C   O R B I T A L   A N D
          N A T U R A L   B O N D   O R B I T A L   A N A L Y S I S
*******************************************************************************
  (c) Copyright 1996-2008 Board of Regents of the University of Wisconsin System
      on behalf of the Theoretical Chemistry Institute.  All Rights Reserved.

          Cite this program as:

          NBO 5.G.  E. D. Glendening, J. K. Badenhoop, A. E. Reed,
          J. E. Carpenter, J. A. Bohmann, C. M. Morales, and F. Weinhold
          (Theoretical Chemistry Institute, University of Wisconsin,
          Madison, WI, 2004); http://www.chem.wisc.edu/~nbo5

       /3CBOND / : Search for 3-center bonds
       /NLMO   / : Form Natural Localized Molecular Orbitals
       /NRT    / : Natural Resonance Theory Analysis
       /AONBO  / : Write the AO to NBO transformation to LFN 37
       /AONLMO / : Write the AO to NLMO transformation to LFN 39
       /NAOMO  / : Print core and valence MOs in the NAO basis
       /NBONLMO/ : Write the NBO to NLMO transformation to LFN 49
       /NLMOMO / : Write the NLMO to MO transformation to LFN 49
       /STERIC / : Print NBO/NLMO steric analysis
       /CMO    / : Print analysis of canonical MOs
       /FILE   / : Set to adfnbo                                             

Filename changed to adfnbo3                                             

Job title: ***simple NBO example for water         

Storage needed:        1120 in NPA,         878 in NBO,
                         863 in NLMO (    10000000 available)


Atom distance matrix: (Angstroms)                                             

     Atom    1       2       3
     ---- ------  ------  ------
   1.  O  0.0000  0.9000  0.0000
   2.  H  0.9000  0.0000  0.9000
   3.  H  0.0000  0.9000  0.0000
Sample Text

算了很久都没反应，我机器够快的了，intel em64 3.0G, 8 core, 我用的：gennbo -n 8, 结果只有一个核工作，而且很长时间没变化，至少好几个小时吧。
目录中有：                                                                                       文件大小
/opt/adf200901/examples/adf/H2O_ADFNBO/H2O_ADFNBO.run
/opt/adf200901/examples/adf/H2O_ADFNBO/TAPE15                     384K
/opt/adf200901/examples/adf/H2O_ADFNBO/adfnbo.kf                    20K
/opt/adf200901/examples/adf/H2O_ADFNBO/adfnbo3.37                 0K
/opt/adf200901/examples/adf/H2O_ADFNBO/adfnbo3.39                 0K
/opt/adf200901/examples/adf/H2O_ADFNBO/adfnbo3.48                 3.2MB
/opt/adf200901/examples/adf/H2O_ADFNBO/adfnbo3.49                 0k
/opt/adf200901/examples/adf/H2O_ADFNBO/FILE47                        29k
/opt/adf200901/examples/adf/H2O_ADFNBO/logfile                          38k
/opt/adf200901/examples/adf/H2O_ADFNBO/TAPE21                       620k


这是为何，编译不对，可是没报错编译的错呀！
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1楼 2010-04-10 20:27:33
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币+1): 2010-04-11 16:30
nbo不支持并行、多核。改单核试试吧
赞一下(2人) 回复此楼
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
2楼2010-04-11 12:31:04
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wtscrystal

银虫 (小有名气)
★
aylayl08(金币+1):感谢讨论 2010-04-13 20:20
其实并不是单核多核的问题，是32位和64位的关系，原来编译的是64位，运行到上面那个地方后就不动，换了32位就没事了！
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2010-04-13 07:14:45
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lipeng87

木虫 (小有名气)

求助

★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
请问楼主：您是怎样编译ADFNBO的？能否指导一下，我正找这种方法呢，呵呵请楼主分享
赞一下(1人) 回复此楼
不抛弃，不放弃
4楼2011-03-07 22:22:54
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