24小时热门版块排行榜    

查看: 1140  |  回复: 3

wtscrystal

银虫 (小有名气)

[交流] 【讨论】ADF NBO有这么慢吗? 已有3人参与

我自己编译了一个NBO standalone: gennbo.exe, 放到:/opt/adf200901/bin下
然后测试:
/opt/adf200901/examples/adf/H2O_ADFNBO中的NBO计算,结果显示:

*********************************** NBO 5.G ***********************************
             N A T U R A L   A T O M I C   O R B I T A L   A N D
          N A T U R A L   B O N D   O R B I T A L   A N A L Y S I S
*******************************************************************************
  (c) Copyright 1996-2008 Board of Regents of the University of Wisconsin System
      on behalf of the Theoretical Chemistry Institute.  All Rights Reserved.

          Cite this program as:

          NBO 5.G.  E. D. Glendening, J. K. Badenhoop, A. E. Reed,
          J. E. Carpenter, J. A. Bohmann, C. M. Morales, and F. Weinhold
          (Theoretical Chemistry Institute, University of Wisconsin,
          Madison, WI, 2004); http://www.chem.wisc.edu/~nbo5

       /3CBOND / : Search for 3-center bonds
       /NLMO   / : Form Natural Localized Molecular Orbitals
       /NRT    / : Natural Resonance Theory Analysis
       /AONBO  / : Write the AO to NBO transformation to LFN 37
       /AONLMO / : Write the AO to NLMO transformation to LFN 39
       /NAOMO  / : Print core and valence MOs in the NAO basis
       /NBONLMO/ : Write the NBO to NLMO transformation to LFN 49
       /NLMOMO / : Write the NLMO to MO transformation to LFN 49
       /STERIC / : Print NBO/NLMO steric analysis
       /CMO    / : Print analysis of canonical MOs
       /FILE   / : Set to adfnbo                                             

Filename changed to adfnbo3                                             

Job title: ***simple NBO example for water         

Storage needed:        1120 in NPA,         878 in NBO,
                         863 in NLMO (    10000000 available)


Atom distance matrix: (Angstroms)                                             

     Atom    1       2       3
     ---- ------  ------  ------
   1.  O  0.0000  0.9000  0.0000
   2.  H  0.9000  0.0000  0.9000
   3.  H  0.0000  0.9000  0.0000
Sample Text

算了很久都没反应,我机器够快的了,intel em64 3.0G, 8 core, 我用的:gennbo -n 8, 结果只有一个核工作,而且很长时间没变化,至少好几个小时吧。
目录中有:                                                                                       文件大小
/opt/adf200901/examples/adf/H2O_ADFNBO/H2O_ADFNBO.run
/opt/adf200901/examples/adf/H2O_ADFNBO/TAPE15                     384K
/opt/adf200901/examples/adf/H2O_ADFNBO/adfnbo.kf                    20K
/opt/adf200901/examples/adf/H2O_ADFNBO/adfnbo3.37                 0K
/opt/adf200901/examples/adf/H2O_ADFNBO/adfnbo3.39                 0K
/opt/adf200901/examples/adf/H2O_ADFNBO/adfnbo3.48                 3.2MB
/opt/adf200901/examples/adf/H2O_ADFNBO/adfnbo3.49                 0k
/opt/adf200901/examples/adf/H2O_ADFNBO/FILE47                        29k
/opt/adf200901/examples/adf/H2O_ADFNBO/logfile                          38k
/opt/adf200901/examples/adf/H2O_ADFNBO/TAPE21                       620k


这是为何,编译不对,可是没报错编译的错呀!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币+1): 2010-04-11 16:30
nbo不支持并行、多核。改单核试试吧
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
2楼2010-04-11 12:31:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wtscrystal

银虫 (小有名气)

★
aylayl08(金币+1):感谢讨论 2010-04-13 20:20
其实并不是单核多核的问题,是32位和64位的关系,原来编译的是64位,运行到上面那个地方后就不动,换了32位就没事了!
3楼2010-04-13 07:14:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lipeng87

木虫 (小有名气)

求助

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
请问楼主:您是怎样编译ADFNBO的?能否指导一下,我正找这种方法呢,呵呵请楼主分享
不抛弃,不放弃
4楼2011-03-07 22:22:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wtscrystal 的主题更新
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 2rKfVQg2jQww 2026-11-06 16/800 2026-11-09 06:54 by l48hFd8Nwae2
[考研] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 13/650 2026-11-09 06:50 by l48hFd8Nwae2
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 12/600 2026-11-09 06:32 by l48hFd8Nwae2
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 14/700 2026-11-09 06:32 by l48hFd8Nwae2
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 8/400 2026-11-09 00:14 by l48hFd8Nwae2
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 9/450 2026-11-08 22:46 by l48hFd8Nwae2
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 11/550 2026-11-06 16:32 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 16:12 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +6 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 12/600 2026-11-06 16:10 by 5sJFDKp2kwuI
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 11/550 2026-11-06 16:10 by 5sJFDKp2kwuI
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +6 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 11/550 2026-11-06 13:47 by BkA9Bi5cMhkD
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +7 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 17/850 2026-11-06 13:47 by BkA9Bi5cMhkD
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +7 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 14/700 2026-11-06 13:47 by BkA9Bi5cMhkD
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +8 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 18/900 2026-11-06 13:36 by BkA9Bi5cMhkD
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05 10/500 2026-11-06 12:32 by BkA9Bi5cMhkD
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 kvewwGtKktqB 2026-11-04 14/700 2026-11-06 05:10 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 8/400 2026-11-06 02:24 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 9/450 2026-11-06 02:02 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +6 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 10/500 2026-11-06 01:51 by qL1cU46YIdK0
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 12/600 2026-11-06 01:42 by qL1cU46YIdK0
信息提示
请填处理意见