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fight1man

金虫 (小有名气)

[求助] 要哭了,使用AUTODOCK的大侠们来帮我看看,这个到底问题出在哪啊

这是我的对接结果 ,同学的其他药物对接结果都好的,能量也比较低 构像数也多 我不知道为什么的能量不是很低  更奇怪的是 构像数最多的也只要两个
请大家帮我分析分析吧 我真的是焦头烂额了


可旋转是键数量



[ Last edited by fight1man on 2012-3-2 at 17:37 ]
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winterose_

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

改变下最后cluster的rmsd值看一下?你的分子柔性这么大,但是GA runs计算的这么少,非常不靠谱呀。要增加计算的次数,然后适当增大cluster rmsd的值,默认是2.0,你可以用4.0嘛。
11楼2013-09-28 11:00:28
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