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liuyu_sdili

木虫 (正式写手)

[求助] 正反向引物长度差别较大可用吗?

最近用primer premier 设计pcr引物,发现得分较高的几对引物正反向引物长度的差别都比较大,有的甚至能达到6个碱基,Tm值差别我控制在1度以内,请问这种引物是否可用?正反向引物之间的差别需要控制在几个碱基之内??
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dingke_s

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
liuyu_sdili(金币+3): ★★★很有帮助 恩,我也这么认为~~ 2012-03-01 14:12:51
小丹木木(金币+2): 鼓励应助 2012-03-01 17:06:37
长度的差别觉得影响不是很大,关键是你设计的引物特异性好不好,有没有二聚体,有没有错配之类的;之前也p过两个引物长度差5、6个碱基的,反正是扩出来了。而且还有一点是这样,软件显示的Tm值和送过来的引物订单上的Tm值还是有一定的差距的,尽量让Tm值差的不要太多,应该就可以。
2楼2012-03-01 13:10:09
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