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用SwissModel预测只能得到蛋白质的一大部分的三维结构,why?
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sk8er8irl
铁虫
(初入文坛)
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(幼儿园)
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在线: 9.4小时
虫号: 1616105
[交流]
用SwissModel预测只能得到蛋白质的一大部分的三维结构,why?
我今天用SwissModel预测某蛋白结构,该蛋白共270个氨基酸残基,但只能得到Modelled residue range: 2 to 212 的氨基酸的三维结构,为啥。。。是因为找不到同源template吗?
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星晴xinqing
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1楼
2012-02-27 15:09:40
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枯荷
新虫
(初入文坛)
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虫号: 1552022
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
http://swissmodel.expasy.org/
可以用这个网页在线预测
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15楼
2012-03-27 20:16:41
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lxj341401
至尊木虫
(著名写手)
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(硕士)
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虫号: 111074
★
sk8er8irl(金币
+1
):谢谢参与
SwissModel预测蛋白结构只能根据模板来建模的,如果模板比你要预测的蛋白序列更短,多余部分是不能建模的。
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3楼
2012-02-27 18:51:55
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imyting
至尊木虫
(正式写手)
MolEPI: 6
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(初中生)
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帖子: 808
在线: 168.7小时
虫号: 736362
★
sk8er8irl(金币
+1
):谢谢参与
用DS中的预测模块试试吧,SWISS-MODEL不准的
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4楼
2012-02-27 20:02:21
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Echosc
新虫
(初入文坛)
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(幼儿园)
金币: 10.3
帖子: 3
在线: 1.6小时
虫号: 1434259
★
sk8er8irl(金币
+1
):谢谢参与
并建议一下,建模比对完了之后,要看精细结构建议用软件BallViewer,别用RasMol
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5楼
2012-02-27 20:07:52
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