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sk8er8irl

铁虫 (初入文坛)


[交流] 用SwissModel预测只能得到蛋白质的一大部分的三维结构,why?

我今天用SwissModel预测某蛋白结构,该蛋白共270个氨基酸残基,但只能得到Modelled residue range: 2 to 212  的氨基酸的三维结构,为啥。。。是因为找不到同源template吗?
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sk8er8irl(金币+1):谢谢参与
SwissModel预测蛋白结构只能根据模板来建模的,如果模板比你要预测的蛋白序列更短,多余部分是不能建模的。
3楼2012-02-27 18:51:55
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imyting

至尊木虫 (正式写手)



sk8er8irl(金币+1):谢谢参与
用DS中的预测模块试试吧,SWISS-MODEL不准的
4楼2012-02-27 20:02:21
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Echosc

新虫 (初入文坛)



sk8er8irl(金币+1):谢谢参与
并建议一下,建模比对完了之后,要看精细结构建议用软件BallViewer,别用RasMol
5楼2012-02-27 20:07:52
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星晴xinqing

新虫 (初入文坛)



sk8er8irl(金币+1):谢谢参与
送鲜花一朵
马上也要做这方面的东西了,学习一下
6楼2012-02-28 10:20:14
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