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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 菜鸟，关于转录因子和转录起始位点的一些问题
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sk8er8irl

铁虫 (初入文坛)

[求助] 菜鸟，关于转录因子和转录起始位点的一些问题

最近在做某基因的研究，该基因很短，有两个转录本。下面简短信息是从Genbank上摘录下来的。
gene            1..5178
mRNA           join(1..590,3550..5176)
mRNA           join(1122..1254,3550..5178)
CDS             3575..4387
CDS             3575..4387
1、不论是哪个转录本，转录起始位点应该不是1或者1122的位置（就是mRNA的第一个核苷酸）。那从 转录起始位点 到 1或者1122位点 的这段区域是什么？还是5‘UTR区的一部分吗？
2、研究已确认该基因两个外显子中第一个外显子为非编码外显子？想问下这个外显子是干嘛的？是不是后来和内含子一样的命运被剪切掉了？

谢谢大侠解答！
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1楼 2012-02-23 17:16:05
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sk8er8irl

铁虫 (初入文坛)
啊，求助啊求助啊！！！
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2楼2012-02-23 23:09:28
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猪妹妹May

铁虫 (初入文坛)
同问，转录起始位点到底是不是外显子的第一个碱基呢？还是只是个模糊的概念？
我需要寻找大致的启动子区域（转录因子结合位点），但不清楚如何判断转录起始位点。。
TSS是不是第一个外显子，也就是NCBI上的mRNA的1号位置往前推2k可以认为是启动子区域呢……
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3楼2020-05-22 04:43:04
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