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蛋白质很纯,但不长晶体
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格格Caroline
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蛋白质很纯,但不长晶体
小妹刚刚学习蛋白质结晶,有很多不会的地方。
我做的蛋白350个aa,很纯了,点晶体就是不长,不是直接沉淀了就是透明的,预测了没有什么信号肽之类的,求助啊!!!!!!!就是不长~!!!!我应该在哪些方面在进行改进呢!!!谢谢谢谢!
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1楼
2012-02-14 21:34:37
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格格Caroline
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引用回帖:
楼
:
Originally posted by
BioChemCom
at 2012-02-15 17:16:51:
这个方面的问题,其实挺复杂的,你给出的哦信息也不够明确。我觉得有几件事情需要考虑。
1. 你的蛋白构建是不是够好,两端的无规则序列是否删除了?
2. 就算两端都删除了,还是要做一系列的截断构建,用于探索可 ...
我的蛋白是个乙烯形成酶,我拿软件预测了,应该是没有信号肽之类的,但是不同软件预测的二级结构不同,搞得我想截断也不知道确切去哪里截。
然后...我今天考虑到是不是加点Mn离子 和akg.看能不能长晶体。
再就是,我最后能想出的是 建模之后预测至少有一个二硫键,看加点DTT?
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5楼
2012-02-15 20:28:47
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格格Caroline: 回帖置顶 2012-02-15 20:30:22
格格Caroline: 取消置顶 2012-02-15 20:30:43
你点晶体要用那个筛选试剂盒呀!有很多条件的呀!都不长吗?
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思想是行动的种子!
2楼
2012-02-15 17:12:29
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BioChemCom
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格格Caroline: 回帖置顶 2012-02-15 20:26:04
西瓜(金币+3): Good! 2012-02-15 22:21:27
这个方面的问题,其实挺复杂的,你给出的哦信息也不够明确。我觉得有几件事情需要考虑。
1. 你的蛋白构建是不是够好,两端的无规则序列是否删除了?
2. 就算两端都删除了,还是要做一系列的截断构建,用于探索可能的稳定表达的结构域。这些可以通过已有的晶体结构、生物信息学相关的分析软件来获得信息。
3. 纯化过程,也有一些问题要考虑,温度、Ni-NTA,分子筛和离子柱。
希望有更详细的信息。
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3楼
2012-02-15 17:16:51
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感谢参与,应助指数 +1
ph 和沉淀剂浓度 是最先考虑的
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不让吃就去死
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2012-02-15 20:02:05
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