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syn1985

木虫 (正式写手)

[求助] 求助链霉菌基因敲除同源重组的方法

我之前用in frame deletion方法构建了基因敲除载体 然后将载体用结合转移的方法转到链霉菌中去了,长出了很多接合子,但是我做传代后挑10个克隆 用PCR鉴定全为野生型,我也抑郁,不知道怎么办
我想重新构建敲除载体,在中间加上抗生素的筛选标记,但是又担心抗生素加进去后会产生极性效应,所以很苦恼,老板催的紧,做不出来就被骂,很抑郁,
大家有没有什么好的建议啊 我该怎么办啊
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srlee

铁杆木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
amisking(金币+4): 很专业啊! 2012-02-09 20:18:30
syn1985(金币+20): ★★★很有帮助 一直都是请教您 谢谢了 2012-02-10 08:56:53
1)In-frame deletion 拿到双交换的机率较低一些,挑10个20个是WT很正常,但多筛选一些,做出来也不是很难的事。
2)如果用抗性基因阻断的话,后续筛选方便,也会很快拿到突变株的。至于polar effect,拿到突变株后做一个回补实验从而排除是极性效应的影响,很多文章中都是这么干的。
3)做实验哪可能都是那么顺利的呢?再郁闷也解决不了问题呀,还是好好整理一下自己的思路,多看一点文献找找方法,以平静的心态去做实验也许就会有转机!
祝实验顺利!
2楼2012-02-09 18:52:53
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