24小时热门版块排行榜

返回列表

当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

hc1027

木虫 (正式写手)

应助: 2 (幼儿园)
金币: 1414.3
散金: 107
红花: 4
帖子: 903
在线: 311.3小时
虫号: 726621
注册: 2009-03-19
专业: 环境微生物学

[求助] 请问大家分析抗性基因（或差异表达基因等相关的）的方法有哪些？比如DNA微阵列。。。

想了解下分析或筛选抗性基因（或差异表达基因等相关的）的方法有哪些？以及优缺点？谢谢大家！请大家针对自己所知道的谈谈吧，做过的话谈谈难易程度及分享下实验心得感想吧。

我知道的有：
DNA微阵列、cDNA-AFLP、抑制消减杂交法SSH等

请问大家目前什么方法比较公认的呢？

回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

生物信息学软件应用

核酸生物学实验经验

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

1楼 2012-01-17 18:46:14

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

hc1027

木虫 (正式写手)

应助: 2 (幼儿园)
金币: 1414.3
散金: 107
红花: 4
帖子: 903
在线: 311.3小时
虫号: 726621
注册: 2009-03-19
专业: 环境微生物学

西瓜: 回帖置顶 2012-01-19 18:20:43

引用回帖:

2楼: Originally posted by liugs at 2012-01-18 08:54:21:
可以先对有抗性的和没有抗性的进行杂交，杂交子代中进行检测是否具有抗性，分离比例是多少，确定该抗性基因的显隐关系，判断是单基因还是多基因控制，最后可以选择基因组AFLP进行图位克隆！

首先感谢您的热心回复。

因为接触这方面比较少，关于真菌抗性基因的筛选我目前看到的文献大多是关于cDNA-AFLP、DNA 微阵列的、其他的了解不多。
我的知识也是主要来自于文献的阅读，看过好些篇用上述方法分析菌的抗性基因的，所以就按照他们的方法照着做。而对你上面讲的杂交、显隐关系论文没见过（至少看出你很专业了，我专业不是学这个的，请见谅），但是觉得你的分析很有道理。能否提供几篇关于你说的方法的论文呢？最好是权威的、英文的。
此外弱弱的问下：
1、对于抗性菌和非抗性菌，cDNA-AFLP获得的差异表达基因（TDF），也只能确定TDF是胁迫下的结果（可能很多个），也不能确定具体是哪个基因决定这种抗性，对吧？
2、然后应该怎么做才能确定是哪个基因决定抗性呢？基因敲除？还是有其他的？
图位克隆能解决这个问题吗？难度以及工作量如何？

O(∩_∩)O谢谢祝新年愉快，阖家幸福！