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hc1027

木虫 (正式写手)

[求助] 请问大家分析抗性基因（或差异表达基因等相关的）的方法有哪些？比如DNA微阵列。。。

想了解下分析或筛选抗性基因（或差异表达基因等相关的）的方法有哪些？以及优缺点？谢谢大家！ 请大家针对自己所知道的谈谈吧，做过的话谈谈难易程度及分享下实验心得感想吧。

我知道的有：
DNA微阵列、cDNA-AFLP、抑制消减杂交法SSH等

请问大家目前什么方法比较公认的呢？
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1楼 2012-01-17 18:46:14
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hc1027

木虫 (正式写手)
西瓜: 回帖置顶 2012-01-19 18:20:43
引用回帖:
2楼: Originally posted by liugs at 2012-01-18 08:54:21:
可以先对有抗性的和没有抗性的进行杂交，杂交子代中进行检测是否具有抗性，分离比例是多少，确定该抗性基因的显隐关系，判断是单基因还是多基因控制，最后可以选择基因组AFLP进行图位克隆！

首先感谢您的热心回复。

因为接触这方面比较少，关于真菌抗性基因的筛选我目前看到的文献大多是关于cDNA-AFLP、DNA 微阵列的、其他的了解不多。
我的知识也是主要来自于文献的阅读，看过好些篇用上述方法分析菌的抗性基因的，所以就按照他们的方法照着做。而对你上面讲的杂交、显隐关系论文没见过（至少看出你很专业了，我专业不是学这个的，请见谅），但是觉得你的分析很有道理。能否提供几篇关于你说的方法的论文呢？最好是权威的、英文的。
此外弱弱的问下：
1、对于抗性菌和非抗性菌，cDNA-AFLP获得的差异表达基因（TDF），也只能确定TDF是胁迫下的结果（可能很多个），也不能确定具体是哪个基因决定这种抗性，对吧？
2、然后应该怎么做才能确定是哪个基因决定抗性呢？基因敲除？还是有其他的？
图位克隆能解决这个问题吗？难度以及工作量如何？


O(∩_∩)O谢谢     祝新年愉快，阖家幸福！
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5楼2012-01-19 09:56:11
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liugs

禁虫 (正式写手)
★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西瓜(金币+3): Good！ 2012-01-18 19:02:32
hc1027(金币+18): ★★★很有帮助 非常感谢，新年快乐 2012-01-19 09:34:06
本帖内容被屏蔽
2楼2012-01-18 08:54:21
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hyhl

铁杆木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
hc1027(金币+5): ★有帮助 谢谢 2012-01-19 09:36:29
据我不多的了解，你说的几种方法应该是现在比较公认的，另外，不知道你有没有看到定量PCR用于你所说的研究目的的。
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3楼2012-01-18 09:54:32
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hc1027

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by hyhl at 2012-01-18 09:54:32:
据我不多的了解，你说的几种方法应该是现在比较公认的，另外，不知道你有没有看到定量PCR用于你所说的研究目的的。

定量PCR 主要是用于后续得到的差异表达基因的研究。
你知道基因敲除吗
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4楼2012-01-19 09:37:41
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