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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 求教： 各种氨基酸在全部蛋白质中出现频率
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jackyma

新虫 (小有名气)

[求助] 求教： 各种氨基酸在全部蛋白质中出现频率

想请教一下关于蛋白质的一些问题：
20种天然氨基酸在所有蛋白质（PDB中登录的蛋白质）中出现的频率统计有没有人做过？我自己搜索到人体蛋白质中各类氨基酸出现频率，但是想得到所有的蛋白质中出现频率的数据。
有没有哪位虫友知道的？

[ 来自科研家族 海外留学 ]
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1楼 2011-11-22 11:10:18
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547star

木虫 (著名写手)
PDB的太少了吧，即使全部非突变蛋白PDB的统计出来，有代表性吗？
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为什么
2楼2011-11-22 13:58:48
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jackyma

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 547star at 2011-11-22 13:58:48:
PDB的太少了吧，即使全部非突变蛋白PDB的统计出来，有代表性吗？

我提问时忽略了PDB里只是部分知道结构的蛋白质，除了PDB数据库里的蛋白质可分析的蛋白质还有别的数据库么？
我只是想得到不同氨基酸在已登录蛋白质中的分布状况，如果没有现成数据自己算又该怎么做，能否给点提示？
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3楼2011-11-23 19:43:34
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547star

木虫 (著名写手)
你可以考虑用swiss-prot的做样本.
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为什么
4楼2011-11-23 20:41:04
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