蛋白质或者氨基酸的粗粒化模拟 - 分子模拟 - MS - 小木虫论坛-学术科研互动平台

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liuyusuc

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1楼 2011-08-01 18:07:22

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liuyusuc

禁虫 (正式写手)

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2楼2011-11-04 19:47:32

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zyj8119

木虫 (著名写手)

★ ★ ★
liuyusuc(金币+1):谢谢参与
liuyusuc(金币+1): 感谢你的指导与帮助！ 2011-11-11 18:28:36
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-11-12 09:24:06

引用回帖:

1楼: Originally posted by liuyusuc at 2011-08-01 18:07:22:
最近在看有关蛋白质进行粗粒化的论文，请大家谈谈是如何进行对于氨基酸或者是蛋白质进行粗粒化模拟的，请各位各抒己见，大家互相学习一下！

这个估计得自己编程做，FRENKEL的那本书里面有DPD的源程序。。。MS里面也有mesocite这样的介观力场模块。。

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3楼2011-11-11 12:46:54

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q1036210267

木虫 (正式写手)

应助: 26 (小学生)
金币: 2182.2
帖子: 893
在线: 262.1小时
虫号: 1346635

★ ★ ★
liuyusuc(金币+1):谢谢参与
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-11-12 09:24:17

coarse grained 模型需要自己去设计，还有里面的参数也需要重调整。

程序要自己去写吧，我也刚接触粗粒不久，具体内容我也不大清楚。

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4楼2011-11-11 14:34:39

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liuyusuc

禁虫 (正式写手)

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5楼2011-11-11 18:30:04

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zyj8119

木虫 (著名写手)

引用回帖:

5楼: Originally posted by liuyusuc at 2011-11-11 18:30:04:
您好，请问你所指的FRENKEL的那本书，到底是哪本书呀？

understanding molecular simulation....

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6楼2011-11-11 20:19:41

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