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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 蛋白质或者氨基酸的粗粒化模拟
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liuyusuc

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1楼2011-08-01 18:07:22
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liuyusuc

禁虫 (正式写手)
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2楼2011-11-04 19:47:32
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zyj8119

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
liuyusuc(金币+1):谢谢参与
liuyusuc(金币+1): 感谢你的指导与帮助！ 2011-11-11 18:28:36
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-11-12 09:24:06
引用回帖:
1楼: Originally posted by liuyusuc at 2011-08-01 18:07:22:
最近在看有关蛋白质进行粗粒化的论文，请大家谈谈是如何进行对于氨基酸或者是蛋白质进行粗粒化模拟的，请各位各抒己见，大家互相学习一下！

这个估计得自己编程做，FRENKEL的那本书里面有DPD的源程序。。。MS里面也有mesocite这样的介观力场模块。。
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3楼2011-11-11 12:46:54
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q1036210267

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
liuyusuc(金币+1):谢谢参与
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-11-12 09:24:17
coarse grained 模型需要自己去 设计，还有里面的参数也需要重调整。

程序要自己去写吧，我也刚接触粗粒不久，具体内容我也不大清楚。
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4楼2011-11-11 14:34:39
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liuyusuc

禁虫 (正式写手)
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5楼2011-11-11 18:30:04
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zyj8119

木虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by liuyusuc at 2011-11-11 18:30:04:
您好，请问你所指的FRENKEL的那本书，到底是哪本书呀？

understanding molecular simulation....
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6楼2011-11-11 20:19:41
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