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求高手指点:RT-PCR的引物设计
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zhywancx
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求高手指点:RT-PCR的引物设计
本人要做荧光定量PCR,知道了RNA序列,是否可以直接根据RNA设计引物?如果知道DNA序列,该如何设计?
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1楼
2011-11-20 15:08:17
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muyanshuang
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小麦基因组测序已经公布一些了,可以查一下。
不过里面未知的基因还是很多的。
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8楼
2011-11-22 11:14:53
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blackrose8089
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【答案】应助回帖
zhywancx(金币+2): 谢谢 2011-11-20 20:05:37
楼主设计引物最好跨内含子,片段长度在80-150bp之间,退火温度一致,可以用在线的primer3或5辅助设计
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jiayoubashaonian
2楼
2011-11-20 17:57:06
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muyanshuang
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一般是可以根据RNA序列设计,荧光定量引物,在基本的引物设计原则下,要求更严格一些。
不允许有引物二聚体和任何杂带!
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3楼
2011-11-21 10:19:14
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zhywancx
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3楼
:
Originally posted by
muyanshuang
at 2011-11-21 10:19:14:
一般是可以根据RNA序列设计,荧光定量引物,在基本的引物设计原则下,要求更严格一些。
不允许有引物二聚体和任何杂带!
嗯,谢谢,那如果只查到了DNA序列,能根据DNA序列设计RT-PCR的引物吗?
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4楼
2011-11-21 11:16:58
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