24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
汕头大学海洋科学接受调剂
查看: 983  |  回复: 1

centian2004

金虫 (正式写手)

[求助] 我该如何表达我的膜蛋白

各位老师:
     您们好!近来,我刚刚做真核表达一个膜蛋白受体,检测这个受体的吞噬功能。对于一个新手来说,实在是碰到了很多难处。想请教大家,希望能得到帮助。
我查了我所要表达的膜蛋白情况,mRNA有2个isoforms(1型和2型),但由同一基因编码。看了一些文献,决定表达2型的这个膜蛋白受体。有几个问题请教:
1)        我表达这个受体,是不是只需要表达CDS部分就可以了吗?(这一部分有起始密码子和终止密码子)
2)        如果只表达CDS部分,翻译后的蛋白会在细胞膜上出现吗?这种在膜上的信息是否在CDS中?
3)        我用verctor 软件看了mRNA结构,发现除了CDS外,还有好多exon,这些enox表达蛋白吗?(CDS只包含了部分enox)我看了这些exon第一个密码子,不是表达蛋白的起始密码子ATG,我想知道这些exon有什么作用,对CDS会有什么影响。
4)        我在查找这个受体时,genebank以C57BL小黑鼠的mRNA,而我所需要的是Balb/c的mRNA则没有。用C57BL的CDS为模板设计引物,会不会不能扩增不出来这个蛋白表达RNA。即C57BL 和Balb/c 这个蛋白的RNA差异大吗?我该怎么办?
我所表达的这个膜蛋白是:CD204(小鼠)。谢谢大家!

[ Last edited by centian2004 on 2011-11-18 at 22:45 ]
回复此楼
搞搞小细菌,玩玩小病毒
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

凡子1985

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

centian2004(金币+40): 谢谢您! 2011-11-19 12:40:21
1)        我表达这个受体,是不是只需要表达CDS部分就可以了吗?(这一部分有起始密码子和终止密码子)

2)        如果只表达CDS部分,翻译后的蛋白会在细胞膜上出现吗?这种在膜上的信息是否在CDS中?

3)        我用verctor 软件看了mRNA结构,发现除了CDS外,还有好多exon,这些enox表达蛋白吗?(CDS只包含了部分enox)我看了这些exon第一个密码子,不是表达蛋白的起始密码子ATG,我想知道这些exon有什么作用,对CDS会有什么影响。
为什么要用软件看mRNA的结构呢,所有外含子和CDS信息在NCBI上都显示了啊,CDS是包含在exon里面的,比如有些基因有3个外显子,但实际编码蛋白的只是其中的一个内含子的一段序列,其实这个问题很简单,所谓外含子就是最后在成熟mRNA中出现的序列,所谓CDS就是最后在蛋白质中对应的序列,mRNA不一定整个都翻译成蛋白,所以你表达蛋白时只需扩增你的CDS片段就好了,当然只是针对你表达蛋白而言,要研究其他的就另当别论了,至于不编码的外显子序列当然是有作用的,但作用不一
4)        我在查找这个受体时,genebank以C57BL小黑鼠的mRNA,而我所需要的是Balb/c的mRNA则没有。用C57BL的CDS为模板设计引物,会不会不能扩增不出来这个蛋白表达RNA。即C57BL 和Balb/c 这个蛋白的RNA差异大吗?我该怎么办?
你只要查到小鼠的序列就行了,而不管他提供的小鼠的品系,记住品系和种差别很大,一般的品系之间基因差别几乎可以忽略不计,SNP的差别而已。所以放心做。
我所表达的这个膜蛋白是:CD204(小鼠)。谢谢大家!
2楼2011-11-19 05:32:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 centian2004 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求助调剂,跨调 +18 X十甫寸Y 2026-04-11 19/950 2026-04-14 19:26 by Art1977
[考研] 297工科调剂? +13 河南农业大学-能 2026-04-13 13/650 2026-04-14 16:46 by Art1977
[教师之家] 转长聘了 +7 简单化xn 2026-04-13 7/350 2026-04-14 14:50 by xindong
[考研] 105500药学求调剂 +4 x_skys 2026-04-12 4/200 2026-04-14 13:37 by rndfc
[考研] 297工科,求调剂? +13 河南农业大学-能 2026-04-12 13/650 2026-04-13 14:12 by dingyanbo1
[考研] 290求调剂 +18 柯淮然 2026-04-12 20/1000 2026-04-13 12:56 by cyh—315
[教师之家] 山东双非院校考核超级无底线,领导幸灾乐祸,教师遭殃恐 +3 qut2026 2026-04-11 7/350 2026-04-12 20:24 by qut2026
[考研] 0831生医工第一轮调剂失败求助 +12 小熊睿睿_s 2026-04-11 16/800 2026-04-12 16:28 by 钰璞
[考研] 295分求调剂 +13 ?要上岸? 2026-04-10 13/650 2026-04-12 15:37 by laoshidan
[考研] 22408调剂315分 +3 zhuangyan123 2026-04-09 3/150 2026-04-12 00:25 by 蓝云思雨
[考研] 267求调剂 +8 再忙也要吃饭啊 2026-04-09 8/400 2026-04-11 21:42 by cfdbai
[考研] 303求调剂 +14 SereinQ 2026-04-10 15/750 2026-04-11 20:43 by 蓝云思雨
[考研] 电子信息279求调剂,有书读就行 +8 wwwooden 2026-04-08 11/550 2026-04-11 20:22 by cq2548
[考研] 346,工科求调剂 +3 moser233 2026-04-09 3/150 2026-04-11 10:04 by zhq0425
[考研] 调剂 化学 307 +21 73372112 2026-04-09 23/1150 2026-04-10 23:53 by wj165256
[考研] 机械专368 有去处吗 +4 种大树 2026-04-10 4/200 2026-04-10 15:31 by jiajinhpu
[考研] 求调剂 +11 翩翩一书生 2026-04-09 13/650 2026-04-10 10:27 by liuhuiying09
[考研] 材料化工总分334求调剂 +16 Riot2025 2026-04-08 17/850 2026-04-09 20:19 by maddjdld
[考研] 085501机械英二77总分294求调剂,接受跨专业学习 +6 守法公民亓纪 2026-04-08 6/300 2026-04-09 15:55 by wp06
[考研] 软件工程求调剂22软工296分求调剂,接受跨调 +4 yangchen2017 2026-04-08 5/250 2026-04-08 21:56 by 土木硕士招生
信息提示
请填处理意见