24小时热门版块排行榜

>论坛更新日志 (2545)
>虫友互识 (486)
>休闲灌水 (112)
>导师招生 (102)
>考博 (101)
>文献求助 (96)
>教师之家 (61)
>找工作 (60)
>博后之家 (57)
>硕博家园 (57)
>论文道贺祈福 (55)
>论文投稿 (55)
>基金申请 (51)
>考研 (43)
>公派出国 (39)
>招聘信息布告栏 (29)

返回列表

woshiai

银虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 3.5
散金: 64
红花: 1
帖子: 138
在线: 43.5小时
虫号: 1414210
注册: 2011-09-23
专业: 细胞生长与分裂

[求助] 引物设计问题--急！！！

最近刚开始设计引物，用primer 5.0设计，但设计出来的评分不高，又用Primer blast 网上设计了几个，但是具体的没法看它是否有引物二聚体，还有发卡结构什么的。
从网上知道用oligo可以评价引物，如下：
在 Oligo软件界面，File菜单下，选择Open，定位到目的cDNA序列（在primer中，该序列已经被保存为Seq文件），会跳出来两个窗口，分别为Internal Stability（Delta G）窗口和Tm窗口。在Tm窗口中，点击最左下角的按钮，会出来引物定位对话框，输入候选的上游引物序列位置（Primer5已经给出）即可，而引物长度可以通过点击Change－Current oligo length来改变。定位后，点击Tm窗口的Upper按钮，确定上游引物，同样方法定位下游引物位置，点击Lower按钮，确定下游引物。引物确定后，即可以充分利用Analyze菜单中各种强大的引物分析功能了。
但是，我可能primer 用地不熟练，在‘定位到目的cDNA序列（在primer中，该序列已经被保存为Seq文件）’一句中，我原来用primer并没有保存序列为SEQ啊，还有Open下也没有cDNA序列这一选项。我看了这些后太糊涂了，哪位高手指点一下，非常感谢啊！

[ Last edited by woshiai on 2011-11-16 at 16:06 ]

回复此楼