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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » cDNA 全长判断
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dorothy

金虫 (小有名气)

[交流] cDNA 全长判断

我用tail  PCR 得到了目的基因，orffinder 也找到了编码区和内含子，接下来RT-PCR 扩增cDNA 验证内含子的位置，可是我怎么判断cDNA 的5‘UTR和3’UTR呢？
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1楼 2011-11-14 21:54:39
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dorothy

金虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by exon2002 at 2011-11-18 07:34:48:
只有得到全长（这个大概比你想得要更具包括性），确定起始点及ORF，从而找到起始点之前的引导序列和5‘UTR，以及3’UTR。所以RACE技术是得到全长cDNA最简捷的方法。纠正：RACE扩增得不到内含子！（想一想为什么？）

呵呵，谢谢。我的前提是已经得到了DNA序列，包括编码区上下游各2kb 的序列，预测到了起始点和ORF，有的文献会写5‘UTR和3’UTR各多少个bp,我只是奇怪如何判断5‘UTR和3’UTR？，
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10楼2011-11-18 07:56:53
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exon2002

铁杆木虫 (著名写手)
★
dorothy(金币+1):谢谢参与
dorothy(金币+1): 2011-11-16 11:31:33
先克隆全长cDNA，然后与基因组DNA序列比较。
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2楼2011-11-15 10:09:09
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blackrose8089

铁杆木虫 (职业作家)
★
dorothy(金币+1):谢谢参与
dorothy(金币+1): 2011-11-16 11:31:45
5'RACE和3‘RACE技术确定全长序列
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3楼2011-11-15 10:10:47
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dorothy

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by blackrose8089 at 2011-11-15 10:10:47:
5'RACE和3‘RACE技术确定全长序列

呵呵，关键是用不着RACE啊
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4楼2011-11-16 11:32:54
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