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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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dorothy

金虫 (小有名气)


[交流] cDNA 全长判断

我用tail  PCR 得到了目的基因,orffinder 也找到了编码区和内含子,接下来RT-PCR 扩增cDNA 验证内含子的位置,可是我怎么判断cDNA 的5‘UTR和3’UTR呢?
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dorothy

金虫 (小有名气)


引用回帖:
9楼: Originally posted by exon2002 at 2011-11-18 07:34:48:
只有得到全长(这个大概比你想得要更具包括性),确定起始点及ORF,从而找到起始点之前的引导序列和5‘UTR,以及3’UTR。所以RACE技术是得到全长cDNA最简捷的方法。纠正:RACE扩增得不到内含子!(想一想为什么?)

呵呵,谢谢。我的前提是已经得到了DNA序列,包括编码区上下游各2kb 的序列,预测到了起始点和ORF,有的文献会写5‘UTR和3’UTR各多少个bp,我只是奇怪如何判断5‘UTR和3’UTR?,
10楼2011-11-18 07:56:53
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exon2002

铁杆木虫 (著名写手)



dorothy(金币+1):谢谢参与
dorothy(金币+1): 2011-11-16 11:31:33
先克隆全长cDNA,然后与基因组DNA序列比较。
2楼2011-11-15 10:09:09
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dorothy(金币+1):谢谢参与
dorothy(金币+1): 2011-11-16 11:31:45
5'RACE和3‘RACE技术确定全长序列
3楼2011-11-15 10:10:47
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dorothy

金虫 (小有名气)


引用回帖:
3楼: Originally posted by blackrose8089 at 2011-11-15 10:10:47:
5'RACE和3‘RACE技术确定全长序列

呵呵,关键是用不着RACE啊
4楼2011-11-16 11:32:54
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