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dorothy

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[交流] cDNA 全长判断

我用tail PCR 得到了目的基因，orffinder 也找到了编码区和内含子，接下来RT-PCR 扩增cDNA 验证内含子的位置，可是我怎么判断cDNA 的5‘UTR和3’UTR呢？

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1楼 2011-11-14 21:54:39

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dorothy

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引用回帖:

9楼: Originally posted by exon2002 at 2011-11-18 07:34:48:
只有得到全长（这个大概比你想得要更具包括性），确定起始点及ORF，从而找到起始点之前的引导序列和5‘UTR，以及3’UTR。所以RACE技术是得到全长cDNA最简捷的方法。纠正：RACE扩增得不到内含子！（想一想为什么？）

呵呵，谢谢。我的前提是已经得到了DNA序列，包括编码区上下游各2kb 的序列，预测到了起始点和ORF，有的文献会写5‘UTR和3’UTR各多少个bp,我只是奇怪如何判断5‘UTR和3’UTR？，