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q1036210267

木虫 (正式写手)

[求助] Coarse - graining 模型中Lennard - Jones 势能函数的指数是怎么调整的?

Sample Text一般力场中 都选择L-J( 12 - 6 ),但是在  Coarse grained 模型中L-J参数需要自己去调整,有的选择L-J( 9 - 6 ), 也有用L-J( 8.5 - 4 ),我想问下,这些参数是怎么选择和调整的,有什么依据和方法, 万分Sample Text感谢!!!

一般的 L - J 势能方程



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生活中坚持快乐的原则不改变,学习工作中踏实上进!`~`
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q1036210267

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by sdwp1233 at 2011-11-10 16:07:21:
自定义力场里面可以调整,你可以自己建一个力场文件,然后选着相应的LJ势能函数。但是没有L-J( 8.5 - 4 )。

您的意思,就是LJ 指数都是整数,对吗?
还有  Coarse grained 模型中 非键 的能量是怎么处理的?
生活中坚持快乐的原则不改变,学习工作中踏实上进!`~`
3楼2011-11-10 16:36:10
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sdwp1233

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-11-10 21:11:50
q1036210267(金币+3): 2011-11-11 20:26:34
自定义力场里面可以调整,你可以自己建一个力场文件,然后选着相应的LJ势能函数。但是没有L-J( 8.5 - 4 )。
2楼2011-11-10 16:07:21
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zyj8119

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-11-10 21:11:36
引用回帖:
3楼: Originally posted by q1036210267 at 2011-11-10 16:36:10:
您的意思,就是LJ 指数都是整数,对吗?
还有  Coarse grained 模型中 非键 的能量是怎么处理的?

MS中mesocite模块,可以自己定义介观力场。。。
好好学习,天天向上。
4楼2011-11-10 19:58:44
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q1036210267

木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by zyj8119 at 2011-11-10 19:58:44:
MS中mesocite模块,可以自己定义介观力场。。。

您能具体 说下 怎么去调整  有效非键   的参数的吗?
生活中坚持快乐的原则不改变,学习工作中踏实上进!`~`
5楼2011-11-11 14:38:44
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