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Sweetgirl

金虫 (小有名气)

[求助] RT-PCR引物设计

想做虾的乙酰胆碱酯酶基因克隆,但是查了很多资料都没有这方面的资料,大多做的是哺乳类和昆虫类的基因克隆,甲壳类的一直没找到相应文献。
请问这样还可以做下去吗,做的话引物该如何设计呀,哪位高手可以指点下迷津呀!
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love_st

金虫 (著名写手)


【答案】应助回帖

Sweetgirl(金币+2): 谢谢回复,希望这样行得通吧! 2011-10-26 16:14:22
如果没有相关物种的基因,那可以找相似物种,做简并引物
2楼2011-10-26 15:36:07
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Sweetgirl

金虫 (小有名气)

wanhscn: 需用看病理研究相关的基因的序列! 2011-10-27 10:49:18
wanhscn: 虾的携氧蛋白为血蓝蛋白(一价铜),不是所有的昆虫才具有血蓝蛋白! 2011-10-27 11:03:34
引用回帖:
2楼: Originally posted by love_st at 2011-10-26 15:36:07:
如果没有相关物种的基因,那可以找相似物种,做简并引物

虾和昆虫都是节肢动物,用昆虫的基因序列来设计也可以吗?
3楼2011-10-26 15:40:21
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love_st

金虫 (著名写手)


【答案】应助回帖

可以吧,比对找出保守位置设计简并引物,问题不大
4楼2011-10-26 15:43:22
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Sweetgirl

金虫 (小有名气)


wanhscn(金币+1): 做点分子加上去也很有意义! 2011-10-27 10:47:49
引用回帖:
4楼: Originally posted by love_st at 2011-10-26 15:43:22:
可以吧,比对找出保守位置设计简并引物,问题不大

这样的成功率大不大呢,因为我主要不做的不是分子方面,做的毒理,做分子方面主要是看看对基因表达的影响,不能把大部分时间都花在分子方面的!
5楼2011-10-26 15:47:28
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love_st

金虫 (著名写手)


【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by Sweetgirl at 2011-10-26 15:47:28:
这样的成功率大不大呢,因为我主要不做的不是分子方面,做的毒理,做分子方面主要是看看对基因表达的影响,不能把大部分时间都花在分子方面的!

还行,找的相似物种多些,就可以
6楼2011-10-26 17:22:50
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amilie030312

金虫 (正式写手)

就是先做个未知基因然后再做嘛,没啥的,甭担心。
7楼2011-10-27 09:27:44
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lyy5215211

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

我想问下怎么找一个属中的一个种特有的序列 求指点
8楼2013-11-08 15:00:39
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2008915

铁杆木虫 (小有名气)

检查特异性的时候为什么在NCBI中blast很久都没有结果
9楼2014-12-28 21:29:00
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