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ChemiAndy

木虫 (正式写手)


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ghcacj(金币+15, 模拟EPI+1): 谢谢 2011-10-26 10:56:59
pengyong2010(金币+10): 2011-10-26 15:08:26
内容已删除
2楼2011-10-26 10:04:23
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智能机器人

Robot (super robot)

我们都爱小木虫

ChemiAndy

木虫 (正式写手)


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御剑江湖(金币+10, 模拟EPI+1): 谢谢 2011-10-27 17:16:14
MS中的Gulp模块适合你。

看看手册吧。我也没用过。

晶体结构(a,b,c)4%的误差是稍微有点大。拟合力场晶体结构方面的偏差一般能达到2%以内,密度方面小于5%, 晶格能方面小于10%。因为必须考虑实验值也是有误差的。晶格能,蒸发焓这些实验值的误差也在10%左右,刻意弄成跟实验值完全一致没有必要,只要跟类似的物质比,结合能定性大小顺序符合即可;

另外,你还要问自己,即你要研究的问题是什么?这个问题需要多精确的晶格常数值?因为有时候你调了参数,看上去与实验值更接近了,可是一跑动力学,一升高温度,得到的结果反而更差。比如你现在要预测体积膨胀系数,那我建议你先用现在的参数跑一些模拟,得到一些结果,看看跟实验值的误差有多大。如果在5%以内是能够接受的。

初学者往往会产生错觉,以为分子模拟能真实再现所有原子过程并给出精确的实验结果。但其实经典力场本身是个十分粗糙的模型,它忽略了电子的运动,把原子看成是带电荷的球,分子间的作用通过一个简化的数学模型(Buckingham+coulomb)来表达,没有多体作用(可达~5%),没有极化(可达1%),请问你觉得这在多大程度上符合真实的原子结构和相互作用?一般来说, 我们使用分子力学模型并非是为了完全精确预测实验结果,而是来定性地研究某一性质的变化规律,或者现象背后的原子过程。即,关注相对值,而非绝对值。

我并不是不建议你调参数,相反我认为做模拟的都要尝试验证参数,可能的话通过拟合更多的实验数据来改进参数。但是在调参数的时候,要认识到力场模型的局限性,以及它的误差范围和精度范围。想像你拿的是一把最小刻度为cm的尺子,而两根棍子的长度差别是几个mm。你能得到精确的结果吗?

[ Last edited by ChemiAndy on 2011-10-26 at 11:32 ]
4楼2011-10-26 23:52:22
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