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LM王甜

金虫 (初入文坛)

lmwt

[求助] 关于吸附MD方面,跪求指导。

有做吸附方面分子动力学模拟的吗?跪求指导如何建模拟盒子!
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jerkwin

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
不同软件有不同方法, 没有什么通用的技术

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2013-09-28 12:45:15
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技术支持

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
请问你是使用哪款软件建模的 ?
3楼2013-09-28 13:32:07
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LM王甜

金虫 (初入文坛)

lmwt

引用回帖:
3楼: Originally posted by 技术支持 at 2013-09-28 13:32:07
请问你是使用哪款软件建模的 ?

我是用Lampps软件!
4楼2013-09-28 14:49:52
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LM王甜

金虫 (初入文坛)

lmwt

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by jerkwin at 2013-09-28 12:45:15
不同软件有不同方法, 没有什么通用的技术

我是用Lammps软件,初步接触MD及Lammps,在做简单流体加壁面的吸附MD,可否给些指导!
5楼2013-09-28 14:54:08
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tudragon

捐助贵宾 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
LM王甜: 金币+5, 有帮助 2013-09-28 15:58:36
建立一个模型,然后在有吸附用的表面方向不设为周期性边界或建立真空层,在表面附近一定距离上放上吸附原子即可(至于是放顶位、桥位还是空位,要看楼主的体系在实验中反应出的具体情况而定),不过分子动力学模拟吸附有一定困难,如果势能较真实的反应相应的性质则能和真实情况符合较好,若势本身偏差较大,可能原子就飞出去了,容易导致计算失败。
6楼2013-09-28 15:33:46
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tudragon

捐助贵宾 (小有名气)

【答案】应助回帖

另外就是建模软件一般没有固定的,自己编程建模其实也是不错的选择。
7楼2013-09-28 15:34:48
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LM王甜

金虫 (初入文坛)

lmwt

内容已删除
8楼2013-09-28 16:02:49
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