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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 关于吸附MD方面，跪求指导。
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LM王甜

金虫 (初入文坛)

lmwt

[求助] 关于吸附MD方面，跪求指导。

有做吸附方面分子动力学模拟的吗？跪求指导如何建模拟盒子！
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1楼 2013-09-28 09:16:45
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jerkwin

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
不同软件有不同方法, 没有什么通用的技术
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

LM王甜
2楼2013-09-28 12:45:15
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技术支持

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
请问你是使用哪款软件建模的 ？
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3楼2013-09-28 13:32:07
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LM王甜

金虫 (初入文坛)

lmwt
引用回帖:
3楼: Originally posted by 技术支持 at 2013-09-28 13:32:07
请问你是使用哪款软件建模的 ？

我是用Lampps软件！
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4楼2013-09-28 14:49:52
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LM王甜

金虫 (初入文坛)

lmwt
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by jerkwin at 2013-09-28 12:45:15
不同软件有不同方法, 没有什么通用的技术

我是用Lammps软件，初步接触MD及Lammps，在做简单流体加壁面的吸附MD，可否给些指导！
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5楼2013-09-28 14:54:08
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tudragon

捐助贵宾 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
LM王甜: 金币+5, ★有帮助 2013-09-28 15:58:36
建立一个模型，然后在有吸附用的表面方向不设为周期性边界或建立真空层，在表面附近一定距离上放上吸附原子即可（至于是放顶位、桥位还是空位，要看楼主的体系在实验中反应出的具体情况而定），不过分子动力学模拟吸附有一定困难，如果势能较真实的反应相应的性质则能和真实情况符合较好，若势本身偏差较大，可能原子就飞出去了，容易导致计算失败。
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6楼2013-09-28 15:33:46
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tudragon

捐助贵宾 (小有名气)

【答案】应助回帖

另外就是建模软件一般没有固定的，自己编程建模其实也是不错的选择。
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7楼2013-09-28 15:34:48
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LM王甜

金虫 (初入文坛)

lmwt
内容已删除
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8楼2013-09-28 16:02:49
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