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cxch1224

新虫 (小有名气)

[求助] PCR引物怎么根据序列图设计啊?希望哪位大侠指导下,感激不尽

根据序列图设计上下游引物,感激感激感激!!!!!




两张这个序列的图,本人是超级菜鸟,希望哪位大侠不吝赐教
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exon2002

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
wanhscn(金币+2): 鼓励应助! 2011-10-14 18:04:18
cxch1224(金币+5): 弱弱的问一句,这个两端保守序列怎么看?图最右边那些数字是什么? 2011-10-14 18:25:09
对了,要从保守氨基酸序列做backtranslation,利用与你要做的物种最接近的codon usage。得到的是兼并引物。
3楼2011-10-14 08:29:47
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exon2002

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


wanhscn(金币+1): 鼓励应助! 2011-10-14 18:04:28
从两端的高度保守区域选,产物在400-1000bp最好。
2楼2011-10-14 08:26:55
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exon2002

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★ ★
西瓜(金币+3): Good 2011-10-19 18:43:53
就是两端序列最相近的部分,以此部分做backtranslation,然后设计PCR引物。图最右边的数字是该序列最右侧的氨基酸在该肽链中的位置。
4楼2011-10-19 08:02:28
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张建荣

银虫 (小有名气)

从保守序列中找出相同的序列,对应不上的设为摆动序列,引物不宜不过长也不宜过短
执着
5楼2011-10-23 15:13:55
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