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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » PCR引物怎么根据序列图设计啊？希望哪位大侠指导下，感激不尽
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cxch1224

新虫 (小有名气)

[求助] PCR引物怎么根据序列图设计啊？希望哪位大侠指导下，感激不尽

根据序列图设计上下游引物，感激感激感激！！！！！




两张这个序列的图，本人是超级菜鸟，希望哪位大侠不吝赐教
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1楼 2011-10-13 22:47:42
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exon2002

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
wanhscn(金币+1): 鼓励应助！ 2011-10-14 18:04:28
从两端的高度保守区域选，产物在400-1000bp最好。
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2楼2011-10-14 08:26:55
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exon2002

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
wanhscn(金币+2): 鼓励应助！ 2011-10-14 18:04:18
cxch1224(金币+5): 弱弱的问一句，这个两端保守序列怎么看？图最右边那些数字是什么？ 2011-10-14 18:25:09
对了，要从保守氨基酸序列做backtranslation，利用与你要做的物种最接近的codon usage。得到的是兼并引物。
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3楼2011-10-14 08:29:47
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exon2002

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★ ★
西瓜(金币+3): Good 2011-10-19 18:43:53
就是两端序列最相近的部分，以此部分做backtranslation，然后设计PCR引物。图最右边的数字是该序列最右侧的氨基酸在该肽链中的位置。
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4楼2011-10-19 08:02:28
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张建荣

银虫 (小有名气)
从保守序列中找出相同的序列，对应不上的设为摆动序列，引物不宜不过长也不宜过短
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执着
5楼2011-10-23 15:13:55
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wxq999

新虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
西瓜:编辑内容 2011-10-24 17:30
西瓜(金币-10): 2011-10-24 17:30:39
-------------广告内容--------------------

[ Last edited by 西瓜 on 2011-10-24 at 17:30 ]
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6楼2011-10-24 17:09:44
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