| 查看: 1031 | 回复: 1 | ||
zhiyin8028金虫 (初入文坛)
|
[求助]
genebank中18S，26S序列检索求助
|
|
各位虫友： 大家好！小弟最近在做唇形科lamiaceae植物ITS序列分析，想自己设计一对引物，需要查找最好是该科内属种的18S（至少要知道18S结尾的一二百bp）和26S（至少要知道26S开始的一二百bp）（18S和26S属于保守序列）序列的部分或全部序列，根据保守序列设计引物，但是在genebank里输入检索词后，有大量的结果，但不少序列是18S-ITS1-5.8S-ITS2-26S单元的中间部分序列，关于18S和26S多数最多几十bp的片段，而且变化较大（不同文献对两段序列长度的界定也有一定差异），无法据此确定保守序列，如何在genebank里查到唇形科lamiaceae里的相关属或今源科属的18S或26S的complete sequence，或者较长的序列呢？以便根据相关序列比对，确定保守序列。自己的检索水平有限，不知道如何在上完个检索结果中找到自己需要的序列，望塔里的高手给予指导，先谢了！ 另外还有两个小问题，1能不能在ncbi里直接查找一小段核酸序列？2如何对ncbi（或者某一子库如genebank）检索结果中得到的全文进行检索？ |
回复此楼» 猜你喜欢
咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否
已经有27人回复
-
为什么余额宝的年化利率越来越低？主要原因有哪些？
已经有3人回复
-
2027广东省杰青
已经有9人回复
-
朋友圈看到的
已经有5人回复
-
欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律
已经有110人回复
-
明天放榜？
已经有5人回复
-
时间戳变了，能看出什么问题？
已经有11人回复
-
重要消息，中午系统在维护
已经有10人回复
-
两姐妹，一个辛辛苦苦30岁工作当大学教师，另一个23岁就工作当开车教练
已经有7人回复
-
投稿咨询
已经有6人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 已经在Gene bank中查找到了某个基因的序列， 如何设计PVR的上下游引物呢？
已经有7人回复
- 【求助/交流】跟已知序列一样还能提交genebank么?
已经有4人回复
- 翻译：附件是拟提交GENEBANK的水稻分离物序列，请给以处理，谢谢。
已经有2人回复
- 【求助/交流】求关于序列上传到GENBANK的相关问题
已经有5人回复
- 【求助/交流】寻找基因组序列中的单拷贝基因
已经有8人回复
- 【求助/交流】如何找到序列中的内含子
已经有6人回复
- 【求助/交流】genebank 登录号
已经有12人回复
- 【求助/交流】如何查找mRNA序列的阅读框？求助！
已经有7人回复
- 【求助/交流】请问，有没有谁知道，如何从NCBI上批量下载一类gene的核苷酸序列？
已经有13人回复
- 【求助/交流】怎样在一段序列中查找可能的测序引物？
已经有4人回复
- 【求助/交流】怎样从一段序列中查找基因结构
已经有12人回复
2楼2011-12-24 15:17:22
