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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » PCR ， 双酶切，连接问题
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青菜小虫

银虫 (著名写手)

风居住的街道

[求助] PCR ， 双酶切，连接问题

请问一下PCR用高保真的酶P 3000多的片段，突变率大吗？还有PCR 的目的片段纯化后，双酶切效果如何？把两个目的片段同时往载体上连的话，一个片段是3000bp，一个是2000bp，载体5380bp，用的是TAKARA的连接试剂盒，两个片段的合适比例是多少啊？
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生命即这般无尽变数，辗转来去皆苛求不得
1楼 2011-08-27 11:09:59
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天使托

专家顾问 (职业作家)

T.Shen

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
西瓜(金币+5): Good 2011-08-28 22:57:20
西瓜(MolEPI+1): 补上 2011-08-28 22:57:34
用taq plus酶应该没有什么问题的，3000bp的条带至于亮不亮就看你的PCR水准了，当然了不亮并不代表连接不上！
楼主做连接难道是想把两个外源片段同时连接进载体吗？不是这样最好，你可以先连接上一个，再酶切连接另外一个的，至于连接体系什么的，这得看你的载体和基因酶切纯化后的量了，如果量相当的话，基因可以是载体的2倍，具体还要定量的。。。一般原则上有公式：1/10<载体质量/载体大小/基因质量/基因的大小<1/3,按照这个公式你就可以直接算出你体系里面的各种物质的添加量了。。。
如果一次成功的话，基因一个礼拜你就可以搞定所有验证工作了，
祝你好运！
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Whenever,Wherever,Anyway!MustRemember:Fight!KeepFighting!NeverGiveUp!
14楼2011-08-28 22:23:47
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blackrose8089

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

青菜小虫(金币+5): 谢谢你的解答。 2011-08-27 14:26:48
1949stone(MolEPI+1): 这个要epi 13k的 可以么？ 2011-08-27 21:22:53
我们实验室扩增长片段常用的是Takara的primer star，有记录的是7.3k。没错碱基，楼主可以试一下！目的片段纯化后如果量足够大，酶切也没问题的，别忘了加上保护碱基。两个大片段往载体上连接难度可能大些，但也能成功，曾经连接过14k，1k，700bp的和7.3k，3.8k，700bp的能连上但费了不少功夫！关于比例这个楼主最好咨询一下技术顾问，偶也没太多的经验，就是多做了些连接转化就搞定了！
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jiayoubashaonian
2楼2011-08-27 12:08:07
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青菜小虫

银虫 (著名写手)

风居住的街道

引用回帖:
2楼: Originally posted by blackrose8089 at 2011-08-27 12:08:07:
我们实验室扩增长片段常用的是Takara的primer star，有记录的是7.3k。没错碱基，楼主可以试一下！目的片段纯化后如果量足够大，酶切也没问题的，别忘了加上保护碱基。两个大片段往载体上连接难度可能大些，但也能 ...

你说的Takara的primer star，我在Takara的目录上没有找到，能给我具体指一下名称吗？还有目的片段纯化后酶切为什么要加保护碱基？再麻烦你一下啦
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生命即这般无尽变数，辗转来去皆苛求不得
3楼2011-08-27 14:53:25
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青菜小虫

银虫 (著名写手)

风居住的街道

引用回帖:
2楼: Originally posted by blackrose8089 at 2011-08-27 12:08:07:
我们实验室扩增长片段常用的是Takara的primer star，有记录的是7.3k。没错碱基，楼主可以试一下！目的片段纯化后如果量足够大，酶切也没问题的，别忘了加上保护碱基。两个大片段往载体上连接难度可能大些，但也能 ...

如果酶切位点不是很靠边的话，是不是保护碱基也可以不用加？
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生命即这般无尽变数，辗转来去皆苛求不得
4楼2011-08-27 14:57:28
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