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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 请教个问题16S rDNA
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greenzhao

木虫 (小有名气)

[交流] 请教个问题16S rDNA 已有2人参与

请问16S rDNA算不算是Protein-coding nucleotide sequence data?
多谢各位牛人了
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1楼 2011-08-13 11:03:46
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guozhibin

银虫 (小有名气)
个人意见  不算
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2楼2011-08-13 12:25:00
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416114799

至尊木虫 (知名作家)
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
西瓜(金币+5, MolEPI+1): 回答很详尽了 2011-08-13 15:53:04
16SrRNA为核糖体的RNA的一个亚基，16SrDNA就是编码该亚基的基因。一般鉴定菌种都要检测16S rDNA，在细菌的16SrDNA中有多个区段保守性，根据这些保守区可以设计出细菌通用物，可以扩增出所有细菌的16SrDNA片段，并且这些引物仅对细菌是特异性的，也就是说这些引物不会与非细菌的DNA互补，而细菌的16SrDNA可变区的差异可以用来区分不同的菌。因此，16SrDNA可以作为细菌群落结构分析最常用的系统进化标记分子。
而Protein-coding nucleotide sequence data往往用在MEGA软件中，即用于建立进化树系统时出现，当你引入很多不同菌种的核酸序列进行系统进化树建立时，它会问你是否是“Protein-coding nucleotide sequence data？”要选择是，然后再一些简单操作，进化树就建立完毕。
因此，得出以下结论：
①、16S rDNA是原核生物三个保守核算片段的保守片段，其对应的16S rRNA由RNA聚合酶I合成；
②、可以用它构建系统进化树；
③、在蛋白质编码过程中，它起着重要作用，蛋白质合成一共要核糖体大小亚基、mRNA、起始tRNA、3中起始因子和GTP，核糖体大小亚基是由对应的DNA编码的，当然，16S rDNA是其中一种；
所以，16S rDNA当然是编码蛋白质的一种核酸序列数据，因为它在大小核糖体亚基的编码中有作用，这也符合MEGA软件中问你***是否是***的问题，其中系统进化树构建完后，他们之间的“距离”就是16S rDNA之间的差别。
赞一下(3人) 回复此楼
做人做事要低调,默默践行心中的梦想.
3楼2011-08-13 14:13:47
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