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至尊木虫 (知名作家)

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专业: 环境微生物学

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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
西瓜(金币+5, MolEPI+1): 回答很详尽了 2011-08-13 15:53:04

16SrRNA为核糖体的RNA的一个亚基，16SrDNA就是编码该亚基的基因。一般鉴定菌种都要检测16S rDNA，在细菌的16SrDNA中有多个区段保守性，根据这些保守区可以设计出细菌通用物，可以扩增出所有细菌的16SrDNA片段，并且这些引物仅对细菌是特异性的，也就是说这些引物不会与非细菌的DNA互补，而细菌的16SrDNA可变区的差异可以用来区分不同的菌。因此，16SrDNA可以作为细菌群落结构分析最常用的系统进化标记分子。
而Protein-coding nucleotide sequence data往往用在MEGA软件中，即用于建立进化树系统时出现，当你引入很多不同菌种的核酸序列进行系统进化树建立时，它会问你是否是“Protein-coding nucleotide sequence data？”要选择是，然后再一些简单操作，进化树就建立完毕。
因此，得出以下结论：
①、16S rDNA是原核生物三个保守核算片段的保守片段，其对应的16S rRNA由RNA聚合酶I合成；
②、可以用它构建系统进化树；
③、在蛋白质编码过程中，它起着重要作用，蛋白质合成一共要核糖体大小亚基、mRNA、起始tRNA、3中起始因子和GTP，核糖体大小亚基是由对应的DNA编码的，当然，16S rDNA是其中一种；
所以，16S rDNA当然是编码蛋白质的一种核酸序列数据，因为它在大小核糖体亚基的编码中有作用，这也符合MEGA软件中问你***是否是***的问题，其中系统进化树构建完后，他们之间的“距离”就是16S rDNA之间的差别。