| 查看: 1179 | 回复: 3 | |||||
| 本帖产生 1 个 MolEPI ，点击这里进行查看 | |||||
[交流]
如何判断克隆到的基因是否是新基因呢？
|
|||||
|
各位好！ 弱弱的请教下大家，我的测序结果在NCBI上直接比对后显示“No significant similarity found”，这说明什么问题？说明克隆到的基因是新基因，还是在比对过程中有什么问题？谢谢！ 在线等回复！ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 【分子生物】EPI帖 | 蛋白表达纯化鉴定精华 |
» 猜你喜欢
TYK2/JAK1 双靶点工具化合物 Brepocitinib：激酶选择性、研究进展与实验应用全解析
已经有0人回复
-
矢车菊素-3-O-葡萄糖苷质控实录：从一张HPLC图谱读懂纯度与稳定性
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有142人回复
-
恩诺沙星（Enrofloxacin）科研解析：分子特征、LC-MS/MS 检测与实验室使用要点
已经有0人回复
-
Calderasib理化性质与实验操作技术笔记
已经有0人回复
-
RMC-6291怎么用？RAS(ON) 三重复合物工具化合物的实验室实操要点
已经有0人回复
-
苯并呋咱全解析：NBD 荧光衍生化试剂母核的化学特性与实验室应用
已经有0人回复
-
生物质炭与活化剂氢氧化钾混合注意事项
已经有0人回复
-
科研人必读：新一代 KRAS G12C 抑制剂 Olomorasib 的研究进展
已经有0人回复
-
BT-11（Omilancor）研究化合物全解析：从分子结构到实验应用要点
已经有0人回复
-
富马酸贝达喹啉：二芳基喹啉类工具化合物的化学特征
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- Ebook__《基因克隆和DNA分析》第四版中文版
已经有422人回复
- 克隆目的基因
已经有11人回复
- 请问仅仅克隆到两个花生基因全长并做了序列分析，国内杂志能投哪里？
已经有3人回复
- 克隆基因连接到载体上测序发现有一个点突变怎么办？
已经有16人回复
- 【求助/交流】抗病基因克隆或定位
已经有11人回复
- 【求助/交流】基因克隆问题求助！
已经有7人回复
- 【求助/交流】基因家族的克隆
已经有4人回复
- 【求助/交流】求助基因克隆方面的问题解决方案
已经有17人回复
- 【求助/交流】已知基因序列如何克隆获得
已经有18人回复
- 怎样克隆抗性基因及其启动子
已经有8人回复
★ ★ ★ ★ ★ ★
original900(金币+1):谢谢参与
original900(金币+10): 谢谢 2011-08-04 08:32:08
dhd997(金币+5, MolEPI+1): 加油啊 2011-08-04 09:12:59
original900(金币+1):谢谢参与
original900(金币+10): 谢谢 2011-08-04 08:32:08
dhd997(金币+5, MolEPI+1): 加油啊 2011-08-04 09:12:59
|
这个不能说明你克隆到的基因是新基因。 1）在NCBI中进行核苷酸序列比对Blast n，如果选择"Highly similar sequences (megablast) "的话，比对经常会显示“No significant similarity found”，我在比对的时候经常发现我的序列和其他序列同源性（相似性）大于50%都会出现这样的情况，我感觉以前好像没有这样，但不知道具体的原因。这个时候你可以选择比对参数“Somewhat similar sequences (blastn) ”，一般就不会再显示“No significant similarity found”。 2）其次你可以利用DNAman等软件找出序列的编码框，并把序列翻译成氨基酸，然后再利用氨基酸序列进行比对（protein blast, Blast p）,一般也不会出现“No significant similarity found”，除非你的序列真的是新基因序列。 3）再次，要考虑你的序列会不会存在测序或扩增的误差。一般如果要判断你的基因是新基因的话，相似性可能要低于20%。也许还有其他方面的标准！ 祝好运！ [ Last edited by jinkui960 on 2011-8-4 at 00:43 ] |
2楼2011-08-04 00:42:07
简单回复
梦想天行3楼
2017-01-22 10:00
回复
original900(金币+1): 谢谢参与
。 发自小木虫Android客户端
2017-01-22 10:31
回复
original900(金币+1): 谢谢参与
祝福！ 发自小木虫Android客户端
