| 查看: 1135 | 回复: 3 | |||||
| 本帖产生 1 个 MolEPI ，点击这里进行查看 | |||||
[交流]
如何判断克隆到的基因是否是新基因呢？
|
|||||
|
各位好！ 弱弱的请教下大家，我的测序结果在NCBI上直接比对后显示“No significant similarity found”，这说明什么问题？说明克隆到的基因是新基因，还是在比对过程中有什么问题？谢谢！ 在线等回复！ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 【分子生物】EPI帖 | 蛋白表达纯化鉴定精华 |
» 猜你喜欢
Wnt-C59：PORCN靶向化学探针，Wnt信号通路阻断机制与科研应用全解析
已经有0人回复
-
Fexaramine：肠道限制性FXR化学探针，结构特征与信号通路研究全解析
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有129人回复
-
NVS-STG2：靶向STING跨膜域的分子胶类激动剂，结构特征与寡聚化机制研究全解析
已经有0人回复
-
DOTA-GPC3肽（CAS 3066439-94-6）：双功能分子探针前体的结构特征与标记应用解析
已经有0人回复
-
科研用 TLR7/8 双激动剂怎么选？现货与质控要点
已经有0人回复
-
SEL120-34A HCl：CDK8/CDK19高选择性激酶抑制剂
已经有0人回复
-
氢氧化钾活化操作
已经有18人回复
-
散金
已经有68人回复
-
生物质超级电容器
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- Ebook__《基因克隆和DNA分析》第四版中文版
已经有422人回复
- 克隆目的基因
已经有11人回复
- 请问仅仅克隆到两个花生基因全长并做了序列分析，国内杂志能投哪里？
已经有3人回复
- 克隆基因连接到载体上测序发现有一个点突变怎么办？
已经有16人回复
- 【求助/交流】抗病基因克隆或定位
已经有11人回复
- 【求助/交流】基因克隆问题求助！
已经有7人回复
- 【求助/交流】基因家族的克隆
已经有4人回复
- 【求助/交流】求助基因克隆方面的问题解决方案
已经有17人回复
- 【求助/交流】已知基因序列如何克隆获得
已经有18人回复
- 怎样克隆抗性基因及其启动子
已经有8人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
再中一个面上，散金币5000
+5/4290
-
面上中了，意料之外
+3/1642
-
学术人生就像一场马拉松，不松懈、不放弃！祝愿所有为学术梦想而打拼的人都能如愿！
+5/876
-
2026年工程管理与智慧城市国际会议 (EMSC 2026)
+1/444
-
感恩，金币虽然不多，全部散尽，感恩
+1/330
-
第三次申请国自科面上的一点心得分享
+1/100
-
刚查了没中，分享下心情
+2/82
-
面上中了
+1/78
-
散金感谢小木虫
+1/72
-
散金币
+1/56
-
今年国基没中，有点难过，但生活还要继续
+1/38
-
香港城市大学分子电子学方向招收2027年秋季入学博士生
+1/12
-
【即将截止】东北大学理学院 力学 李健组招2027级保研
+1/7
-
2027直博及统招“申请-考核”制博士招生 | 广州国家实验室-中山大学 谢志课题组
+1/7
-
【科研实践合作】邀请老师带学生完成一次严谨的科学表达
+1/6
-
南京大学 智能驱动与感知材料实验室 诚招申请考核博士生/科研助理/博士后
+1/4
-
祈祷老公中国基
+1/3
-
新审查指南施行半年，AI方向的专利申请是不是更看"技术味"了？
+1/2
-
【即将截止】东北大学理学院 力学 李健组2027级保研
+1/1
-
量子物理团队招收博士生与博士后
+1/1
★ ★ ★ ★ ★ ★
original900(金币+1):谢谢参与
original900(金币+10): 谢谢 2011-08-04 08:32:08
dhd997(金币+5, MolEPI+1): 加油啊 2011-08-04 09:12:59
original900(金币+1):谢谢参与
original900(金币+10): 谢谢 2011-08-04 08:32:08
dhd997(金币+5, MolEPI+1): 加油啊 2011-08-04 09:12:59
|
这个不能说明你克隆到的基因是新基因。 1）在NCBI中进行核苷酸序列比对Blast n，如果选择"Highly similar sequences (megablast) "的话，比对经常会显示“No significant similarity found”，我在比对的时候经常发现我的序列和其他序列同源性（相似性）大于50%都会出现这样的情况，我感觉以前好像没有这样，但不知道具体的原因。这个时候你可以选择比对参数“Somewhat similar sequences (blastn) ”，一般就不会再显示“No significant similarity found”。 2）其次你可以利用DNAman等软件找出序列的编码框，并把序列翻译成氨基酸，然后再利用氨基酸序列进行比对（protein blast, Blast p）,一般也不会出现“No significant similarity found”，除非你的序列真的是新基因序列。 3）再次，要考虑你的序列会不会存在测序或扩增的误差。一般如果要判断你的基因是新基因的话，相似性可能要低于20%。也许还有其他方面的标准！ 祝好运！ [ Last edited by jinkui960 on 2011-8-4 at 00:43 ] |
2楼2011-08-04 00:42:07
简单回复
梦想天行3楼
2017-01-22 10:00
回复
original900(金币+1): 谢谢参与
。 发自小木虫Android客户端
2017-01-22 10:31
回复
original900(金币+1): 谢谢参与
祝福！ 发自小木虫Android客户端
投票:
