应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 询问在PDB数据库查找蛋白质结构
汕头大学海洋科学接受调剂
151/1返回列表
查看: 6326  |  回复: 14
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
本帖产生 1 个 BioEPI ，点击这里进行查看

lijinyan208

铁虫 (小有名气)

[交流] 询问在PDB数据库查找蛋白质结构

请问在PDB数据库中怎么查找Pseudomonas fluorescens lipase 的结构？
The 3D structure was obtained  from the Protein Data Bank (PDB) using Pymol vs. 0.99.  The pdb code for PFL is 2LIP. “ using Pymol vs. 0.99.“是什么意思？
回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

czq7013 a13684978 li1014895750 yuanruoshui

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2011-07-30 21:00:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

gwbk

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
lijinyan208(金币+1):谢谢参与
lijinyan208(金币+3): 非常感谢！ 2011-07-31 15:55:43
lstt09nk(金币+8, BioEPI+1): 很详细，很实用 2011-09-14 16:55:56
1，打开PDB网站，直接输入Pseudomonas lipase ，点击搜索，可以得到20个3D结构，其中包含下面的这个“2LIP”，但是PDB数据库并没有Pseudomonas fluorescens lipase这个结构，应该是没有收录这个蛋白的3D结构，或者是没有相关文献，或者是文献正在版权中。。。
2，使用软件pymol 版本0.99在PDB网站上搜索到了“2LIP”的3D结构。2LIP在PDB网站上是PSEUDOMONAS LIPASE OPEN CONFORMATION ，也并不是Pseudomonas fluorescens lipase。
3，你可以先去http://www.expasy.org/sprot或者http://www.uniprot.org/搜索一下蛋白质序列有木有。然后去EBI等网站上搜索一下。但是这并一定能找到蛋白质3D结构。

现在好多数据库都并到PDB、EBI等大网站了。
赞一下(6人) 回复此楼
2楼2011-07-30 23:17:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gwbk

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★
lijinyan208(金币+1): 2011-07-31 15:56:17
lstt09nk(金币+5): 补加 2011-09-14 16:56:07
传1个PDB使用视频，基本功能做的还可以。
赞一下(6人) 回复此楼
3楼2011-07-30 23:36:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lq102021

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
谢谢，同样有利于我
赞一下 回复此楼
5楼2012-07-25 20:00:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zoetseng

铁虫 (小有名气)
有用啊~

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
回复此楼
6楼2013-12-26 16:02:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

asmallfly

新虫 (初入文坛)
非常感谢
回复此楼
8楼2014-09-23 23:56:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lemon_time

金虫 (小有名气)
很有用，谢谢
回复此楼
11楼2015-04-24 10:15:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

congg

新虫 (初入文坛)
谢谢。
回复此楼
12楼2015-11-17 09:05:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuanruoshui

禁虫 (正式写手)
送红花一朵
本帖内容被屏蔽
15楼2018-07-22 22:05:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
czq70134楼
2011-09-14 16:20   回复  
送鲜花一朵
谢谢分享
xzh2097楼
2014-04-20 15:35   回复  
谢谢分享
gbp19889楼
2014-11-15 11:20   回复  
萨米摩尔10楼
2015-01-14 09:39   回复  
谢谢分享！
a1368497813楼
2017-08-08 13:09   回复  
送红花一朵
li101489575014楼
2017-09-07 11:16   回复  
送红花一朵
相关版块跳转 我要订阅楼主 lijinyan208 的主题更新
151/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 291求调剂 +6 关忆北. 2026-04-14 6/300 2026-04-15 13:32 by Llllss12
[考研] 297工科调剂? +14 河南农业大学-能 2026-04-13 15/750 2026-04-15 13:25 by 黑科技矿业
[考研] 085400电子信息类（川大控制工程）求调剂可跨专业 求老师联系 +6 626776879 2026-04-08 6/300 2026-04-14 20:09 by gwjxiaolang
[考研] 求调剂 +9 小聂爱学习 2026-04-11 13/650 2026-04-14 19:18 by Art1977
[考研] 化学070300 求调剂 +23 哈哈哈^_^ 2026-04-12 23/1150 2026-04-14 16:30 by zhouxiaoyu
[考研] 279求调剂 +12 张番茄不炒蛋 2026-04-11 12/600 2026-04-14 15:38 by zs92450
[考研] 305求调剂 +8 玛卡巴卡boom 2026-04-11 8/400 2026-04-14 09:04 by pengliang8036
[考研] 22专硕求调剂 +8 haoyun上岸 2026-04-11 10/500 2026-04-13 22:15 by zhq0425
[考研] 一志愿双非085400电子信息344 求调剂，对材料和化学方向也感兴趣 +12 无情的小羊 2026-04-09 13/650 2026-04-13 14:17 by 张zhihao
[考研] 326求调剂 +6 Shansyn 2026-04-10 6/300 2026-04-12 09:46 by hammer3
[考研] 材料与化工300求调剂 +39 肖开文 2026-04-09 43/2150 2026-04-12 01:30 by 秋豆菜芽
[考研] 299求调剂 +8 ZVVZ13 2026-04-08 8/400 2026-04-12 00:40 by 蓝云思雨
[考研] 303求调剂 +14 SereinQ 2026-04-10 15/750 2026-04-11 20:43 by 蓝云思雨
[考研] 284求调剂 +11 archer.. 2026-04-09 12/600 2026-04-11 20:23 by 蓝云思雨
[考研] 求调剂 +11 翩翩一书生 2026-04-09 11/550 2026-04-11 19:57 by 逆水乘风
[考研] 本人女孩 +7 吼吼， 2026-04-10 9/450 2026-04-11 14:45 by ACS Nano——
[考研] 263能源动力专硕求调剂 +4 加大号饭盒袋 2026-04-10 4/200 2026-04-10 20:52 by gong120082
[考研] 材料专硕(0856) 339分求调剂 +9 哈哈哈鹅哈哈哈 2026-04-09 10/500 2026-04-09 20:01 by Orcid
[考研] 337求调剂 +4 Gky09300550， 2026-04-09 4/200 2026-04-09 17:18 by 帕尔马拉特
[考研] 331求调剂 +5 luoxin0706. 2026-04-08 5/250 2026-04-08 22:15 by zhouyuwinner
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭