| 查看: 6037 | 回复: 14 | |||
| 本帖产生 1 个 BioEPI ，点击这里进行查看 | |||
[交流]
询问在PDB数据库查找蛋白质结构
|
|||
|
请问在PDB数据库中怎么查找Pseudomonas fluorescens lipase 的结构？ The 3D structure was obtained from the Protein Data Bank (PDB) using Pymol vs. 0.99. The pdb code for PFL is 2LIP. “ using Pymol vs. 0.99.“是什么意思？ |
回复此楼» 本帖已获得的红花（最新10朵）
» 猜你喜欢
AI论文写作工具：是科研加速器还是学术作弊器？
已经有5人回复
-
Bioresource Technology期刊，第一次返修的时候被退回好几次了
已经有8人回复
-
寻求一种能扛住强氧化性腐蚀性的容器密封件
已经有7人回复
-
到新单位后，换了新的研究方向，没有团队，持续积累2区以上论文，能申请到面上吗
已经有8人回复
-
申请2026年博士
已经有6人回复
-
请问哪里可以有青B申请的本子可以借鉴一下。
已经有5人回复
-
天津工业大学郑柳春团队欢迎化学化工、高分子化学或有机合成方向的博士生和硕士生加入
已经有5人回复
-
2025冷门绝学什么时候出结果
已经有7人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
求助，已有PDB结构的DS同源建模步骤，谢谢
已经有11人回复- 如何查找已知蛋白质、酶的结构、空间尺寸大小？
已经有4人回复
- 如何查找已知蛋白质、酶的结构、空间尺寸大小？
已经有3人回复
- 求助：关于质谱与蛋白质三级结构的问题！
已经有4人回复
- PDB数据库怎么样？？急！！！！！
已经有7人回复
- 关于蛋白质二级结构数据库
已经有3人回复
- 输入多肽一级序列，输出三级结构pdb文件的软件？
已经有6人回复
- 【求助】请教一下怎么把在PDB数据库上面下载的CIF格式的晶体结构导入MS中
已经有9人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
【MLPA-NGS 技术】Y 染色体微缺失 / SNP 分型 /mtDNA 检测试剂盒，现货直供！
+1/91
-
加拿大/英属哥伦比亚大学曹彦凯课题组招收全奖博士/博后 [机器学习/优化/控制方向]
+1/83
-
2026年博士招生--北京理工大学交叉学科（航空，力学，能动，计算机等方向）
+1/44
-
澳门科技大学2026年数学博士招生—杨钧翔助理教授计算物理与数学课题组
+1/40
-
荷兰Utrecht University超快太赫兹光谱王海教授课题招收2026 CSC博士生
+1/29
-
智慧能源中心招聘启事|博士后 科研助理
+1/28
-
智慧能源中心2026年秋季博士生招生启事
+1/27
-
天津大学建工学院课题组诚招2026级博士研究生
+1/16
-
同济大学段宁院士徐夫元教授团队：招聘博士后+欢迎依托申报海优
+1/14
-
意大利CSC机器人方向博士招生
+1/7
-
招聘2026年入学博士生
+1/7
-
南京航空航天大学航天学院黄护林教授课题组博士研究生招生（工程热物理专业）
+1/6
-
招收26年秋季入学博士生（北科大高精尖学院 力学超材料/机器学习/增材制造相关方向）
+1/4
-
SCI辅 助
+1/3
-
中国科学院大学纳米科学与技术学院-罗聃课题组诚招博士研究生
+1/3
-
招收2026年秋季入学博士生1名（北京科技大学 力学超材料/机器学习/增材制造相关方向）
+1/2
-
北京理工大学珠海校区徐先臣课题组招聘博士后/硕博士
+1/1
-
大连海事大学国家级人才团队2026年博士研究生招生启事
+1/1
-
海南大学化学院 招聘 材料与电化学方向——研究助理，博士（2026年入学）
+1/1
-
上海有机所—林欣蓉研究员(有机能源材料和固态电池方向)院士团队招聘博士后和科研助理
+1/1
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
lijinyan208(金币+1):谢谢参与
lijinyan208(金币+3): 非常感谢！ 2011-07-31 15:55:43
lstt09nk(金币+8, BioEPI+1): 很详细，很实用 2011-09-14 16:55:56
lijinyan208(金币+1):谢谢参与
lijinyan208(金币+3): 非常感谢！ 2011-07-31 15:55:43
lstt09nk(金币+8, BioEPI+1): 很详细，很实用 2011-09-14 16:55:56
|
1，打开PDB网站，直接输入Pseudomonas lipase ，点击搜索，可以得到20个3D结构，其中包含下面的这个“2LIP”，但是PDB数据库并没有Pseudomonas fluorescens lipase这个结构，应该是没有收录这个蛋白的3D结构，或者是没有相关文献，或者是文献正在版权中。。。 2，使用软件pymol 版本0.99在PDB网站上搜索到了“2LIP”的3D结构。2LIP在PDB网站上是PSEUDOMONAS LIPASE OPEN CONFORMATION ，也并不是Pseudomonas fluorescens lipase。 3，你可以先去http://www.expasy.org/sprot或者http://www.uniprot.org/搜索一下蛋白质序列有木有。然后去EBI等网站上搜索一下。但是这并一定能找到蛋白质3D结构。 现在好多数据库都并到PDB、EBI等大网站了。 |
2楼2011-07-30 23:17:02
3楼2011-07-30 23:36:53
5楼2012-07-25 20:00:15
6楼2013-12-26 16:02:59
8楼2014-09-23 23:56:00
11楼2015-04-24 10:15:16
12楼2015-11-17 09:05:20
yuanruoshui
禁虫 (正式写手)
送红花一朵|
本帖内容被屏蔽 |
15楼2018-07-22 22:05:35
简单回复
czq70134楼
2011-09-14 16:20
回复
送鲜花一朵
xzh2097楼
2014-04-20 15:35
回复
谢谢分享
gbp19889楼
2014-11-15 11:20
回复
萨米摩尔10楼
2015-01-14 09:39
回复
谢谢分享！
a1368497813楼
2017-08-08 13:09
回复
送红花一朵
li101489575014楼
2017-09-07 11:16
回复
送红花一朵