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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 不同来源的同一种微生物基因序列是否相同
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whjhx

金虫 (正式写手)

[交流] 不同来源的同一种微生物基因序列是否相同

同一种方法分离自不同地方，比如水、土壤或植物中的同一种微生物，其16S或18S rRNA序列会否不同？或者是否有实质性或功能性的不同？
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1楼 2011-07-15 14:35:24
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fwks3518

木虫 (正式写手)
whjhx(金币+1): 2011-07-17 11:49:07
引用回帖:
Originally posted by whjhx at 2011-07-16 09:24:22:
同一种方法分离自不同地方，比如水、土壤或植物中的同一种微生物，已确定是同种，而且就我个人的目的来说它们的功能是基本相同的，不知道还能利用它们做什么？直白说就是怎么利用它们发篇PAPER呢？

同一种微生物分离自不同环境，意味着为了适应环境，该微生物可能在会存在不同的适应方式，可能存在亚种或者更低层次的分类，可以试着进行分析环境与微生物适应性的关系。
或者这样的素材可以写成比较转录组、比较基因组等比较性文章或者。
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9楼2011-07-17 08:22:48
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xiadongliang

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
whjhx(金币+1):谢谢参与
dhd997(金币+2): 鼓励 2011-07-15 18:51:03
whjhx(金币+2): 2011-07-16 09:24:47
引用回帖:
Originally posted by whjhx at 2011-07-15 14:35:24:
同一种方法分离自不同地方，比如水、土壤或植物中的同一种微生物，其16S或18S rRNA序列会否不同？或者是否有实质性或功能性的不同？

没有功能上的不同，16S和18S不表达。
但是序列估计会有所不同。因为细菌的变异比较大。
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2楼2011-07-15 14:45:00
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whjhx

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by xiadongliang at 2011-07-15 14:45:00:
没有功能上的不同，16S和18S不表达。
但是序列估计会有所不同。因为细菌的变异比较大。

谢谢！研究它们16S和18S序列的不同有没有什么意义啊？会说明什么问题呢？
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3楼2011-07-15 14:55:47
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fwks3518

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
whjhx(金币+1):谢谢参与
dhd997(金币+2): 鼓励 2011-07-15 18:51:17
whjhx(金币+2): 2011-07-16 09:24:39
16s或者18s是看家基因（housekeeping gene），在进化中基本是不会发生重大变异的，变异速率很慢，研究不同微生物16s或18s一般可以构建进化树，或者是鉴定种属关系，一般用于种以上的鉴定。

ps：楼上说16s和18s不表达是不对的，二者都是稳定转录的
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4楼2011-07-15 15:17:35
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