[交流] 不同来源的同一种微生物基因序列是否相同

Originally posted by whjhx at 2011-07-15 14:35:24:
同一种方法分离自不同地方，比如水、土壤或植物中的同一种微生物，其16S或18S rRNA序列会否不同？或者是否有实质性或功能性的不同？

Originally posted by xiadongliang at 2011-07-15 14:45:00:
没有功能上的不同，16S和18S不表达。
但是序列估计会有所不同。因为细菌的变异比较大。

Originally posted by fwks3518 at 2011-07-15 15:17:35:
16s或者18s是看家基因（housekeeping gene），在进化中基本是不会发生重大变异的，变异速率很慢，研究不同微生物16s或18s一般可以构建进化树，或者是鉴定种属关系，一般用于种以上的鉴定。

ps：楼上说16s和18s ...

Originally posted by fwks3518 at 2011-07-15 15:17:35:
16s或者18s是看家基因（housekeeping gene），在进化中基本是不会发生重大变异的，变异速率很慢，研究不同微生物16s或18s一般可以构建进化树，或者是鉴定种属关系，一般用于种以上的鉴定。

ps：楼上说16s和18s ...

Originally posted by whjhx at 2011-07-16 09:24:22:
同一种方法分离自不同地方，比如水、土壤或植物中的同一种微生物，已确定是同种，而且就我个人的目的来说它们的功能是基本相同的，不知道还能利用它们做什么？直白说就是怎么利用它们发篇PAPER呢？

Originally posted by xiadongliang at 2011-07-16 18:19:04:
糊涂了，转录归转录，跟表达还是不一样吧？
既然没有表达出蛋白，还叫表达吗？
彻底搞乱了。

Originally posted by fwks3518 at 2011-07-17 08:22:48:
同一种微生物分离自不同环境，意味着为了适应环境，该微生物可能在会存在不同的适应方式，可能存在亚种或者更低层次的分类，可以试着进行分析环境与微生物适应性的关系。
或者这样的素材可以写成比较转录组、 ...