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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » AutoDock产生的结果dlg文件转化成pdb文件
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zsla380

金虫 (正式写手)

[交流] AutoDock产生的结果dlg文件转化成pdb文件

我在windows下用AutoDock4.2运行得到的结果dlg文件，希望转化成pdb文件，好拿到其它软件中作结果分析，请问有什么好的办法吗？谢谢
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1楼2011-07-15 09:40:01
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晔?�

银虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by userhung at 2011-07-15 23:09:53
用get-dockings name.dlg，则会在目录下自动生成name.pdb文件

具体是要怎么做的？在run autodock 中引入参数文件后是可以直接生成.dlg,但是并不会在目录下生成.pdb文件。
ADT是antodocktool1.5.6rc3版本的。
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14楼2015-02-02 19:15:31
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zh1987hs

金虫 (著名写手)
★
zsla380(金币+2):谢谢参与
zsla380(金币+3): 我用ADT打开dlg文件后再保存为pdbqt,后转为pdb。谢谢了 2011-07-16 12:48:07
引用回帖:
Originally posted by zsla380 at 2011-07-15 09:40:01:
我在windows下用AutoDock4.2运行得到的结果dlg文件，希望转化成pdb文件，好拿到其它软件中作结果分析，请问有什么好的办法吗？谢谢

MGLTools就可以啊
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2011-07-15 22:51:47
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userhung

禁虫 (文学泰斗)
★
zsla380(金币+2):谢谢参与
zsla380(金币+3): 谢谢了。我是windows xp中运行autodock，不会用get-dockings name.dlg 2011-07-16 12:49:05
用get-dockings name.dlg，则会在目录下自动生成name.pdb文件
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2011-07-15 23:09:53
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天下枫叶

木虫 (著名写手)
★
zsla380(金币+2):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by zsla380 at 2011-07-15 09:40:01:
我在windows下用AutoDock4.2运行得到的结果dlg文件，希望转化成pdb文件，好拿到其它软件中作结果分析，请问有什么好的办法吗？谢谢

同问
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6楼2011-07-17 17:02:54
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